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[综合交流] 震惊!Grimme做几何优化和震动分析居然不用同一个计算级别

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楼主
最近在看算pka的相关文章,看到Grimme有发文章参与SAMPL6的pka预测大赛,于是就看看他是怎么算pka的。https://link.springer.com/article/10.1007/s10822-018-0145-7

一看分三步走
GFN-xTB geometries are reoptimized at the PBEh-3c [22] level of theory, including DCOSMO-RS [23], the self-consistent implementation of the COSMO-RS [24, 25] implicit solvation model for water.

Total energies 𝐸𝑒𝑙 are calculated with the DSD-BLYP-D3(BJ)/def2-TZVPD double-hybrid density functional [26,27,28,29].

Solvation contributions 𝛿𝐺298K𝑠𝑜𝑙𝑣 are calculated using the COSMO-RS (fine) continuum solvation model for water [24, 25].

Entropic contributions 𝐺298K𝑅𝑅𝐻𝑂 are calculated in the RRHO approximation using GFN-xTB(GBSA) [18].


我一直都觉得结构优化要和震动分析要用同一个级别,毕竟RRHO要能量最低点,没想到到了grimme这里,几何优化用的是PBEh-3c,震动分析却是用GFN-xTB(GBSA)做的。

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发表于 Post on 2020-12-11 22:40:38 | 只看该作者 Only view this author
可能是先用GFN-xTB优化并作振动分析,再用PBEh-3c作进一步的几何优化,在后者的结构上面算单点能。Grimme不至于不知道优化和振动分析必须在同一个级别。
不过现在这种写法确实容易误解。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2020-12-12 02:51:39 | 只看该作者 Only view this author
他的意思应该是因为对大体系直接做PBEh-3c的振动分析获得熵算不动,于是为了能获得熵,基于GFN-xTB优化的结构做了GFN-xTB级别的振动分析。
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