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[GROMACS] acpype生成拓扑文件失败,是什么原因?老师们有没有知道这是什么原因?

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| ACPYPE: AnteChamber PYthon Parser interfacE v. 0 0 Rev: 0 (c) 2021 AWSdS |
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WARNING: no 'babel' executable, no PDB file as input can be used!
ACPYPE FAILED: [Errno 2] No such file or directory: 'tmp'
Total time of execution: less than a second

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2#
发表于 Post on 2021-1-6 12:50:06 | 只看该作者 Only view this author
同一个问题不要连续提问两次。http://bbs.keinsci.com/thread-21169-1-1.html 这个也是你不到12小时前的提问吧。
不要用这个看着眼睛疼的绿色背景颜色。
你贴的内容没有任何有效信息。基本acpype只要出错都是这种报错。认真检查你输入的.mol2文件,看有没有比如第二周期原子 连了5根键,有些芳香环的键型不合适,芳香环的Ar有没有改成ar等等。运行的时候加上-d选项,看debug信息追踪错误来源。如果实在搞不清楚,把你的输入文件贴上来。

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wangdefa28 + 2 谢谢

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