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[VMD] tcl脚本求助

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Level 4 (黑子)

社长好,最近想对模拟进行分析,在学习tcl,由于没有任何编程基础,所以看的似懂非懂。有些问题想求助,tcl跟vmd的关系搞不懂。
1.例如培训中的例子hb.tcl
% proc hb {fps1 fps2 donor accept} {
set cum 0
for {set i $fps1} {$i<=$fps2} {incr i 1} {
set dd [atomselect top "index $doner" frame $i]
set aa [atomselect top "index $aceept" fram $i]
set temp [measure hbonds 3.5 35 $dd $aa]
if {$temp !="{} {} {}"} {puts $i ; incr cum}
}
puts $cum

中的donor和accept是VMD的选择语句吗比如输入
proc 1 100 resname SOL  resanme SOL

2.vmd中的 atomeselect top "name CA"中的top指的是此时VMD中出现的画面的离子吗


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2#
发表于 Post on 2021-1-15 06:06:42 | 只看该作者 Only view this author
你的使用格式明显不对,讲义上都有现成的例子



如果你有讲义,好好仔细反复复习,绝对不可能看不懂。脚本里每个部分涉及的知识都在我的讲义上介绍得极为详细,没有任何超纲的内容,包括tcl的语法、各种命令的基本用法、条件判断、循环、atomselect的使用、VMD的内置各种命令(如上面脚本里用的measure)等等。

注意复习讲义


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