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楼主 Author: kevin
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[新手求助] 能垒的判断问题

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发表于 Post on 2016-3-18 09:51:37 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2016-3-18 08:51
哇哦,看来事情真的不是那么简单,之前就是简单的找到能垒,然后用这个作为决速步,用这个步骤的反应物和 ...

你可以试试 IBM的 kinetic simulator
http://web.archive.org/web/20071 ... ce/ck/?cks-winfiles
这个需要dosbox+win31(或win95, win98)

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发表于 Post on 2016-3-18 10:16:04 | 只看该作者 Only view this author
xyz 发表于 2016-3-18 09:51
你可以试试 IBM的 kinetic simulator
http://web.archive.org/web/20071026015231/http://www.almaden.i ...

非常感谢您的帮助

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发表于 Post on 2016-3-18 17:29:10 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2016-3-18 08:51
哇哦,看来事情真的不是那么简单,之前就是简单的找到能垒,然后用这个作为决速步,用这个步骤的反应物和 ...

如果按照前面我的幻灯片里的做法,可以很明确第找到一个决速步,那你可以用那个k当成整个反应的k。但对于决速步判断模棱两可的情况就不好说了。
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发表于 Post on 2016-3-19 15:52:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-18 17:29
如果按照前面我的幻灯片里的做法,可以很明确第找到一个决速步,那你可以用那个k当成整个反应的k。但对于 ...

哦哦,这次就明白了,谢谢老师!还有一个问题:
一个多步反应,分别计算每一个步骤的正向和逆向反应速率,最后用公式,来计算总的反应速率,请问老师们这个公式怎么来的啊?请教一下出处,想用这个方法算算自己的东西。

QQ图片20160319155215.png (8.08 KB, 下载次数 Times of downloads: 110)

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发表于 Post on 2016-3-19 17:35:46 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2016-3-19 15:52
哦哦,这次就明白了,谢谢老师!还有一个问题:
一个多步反应,分别计算每一个步骤的正向和逆向反应速率 ...

你查查各种外文的物化书,里面讲反应速率这块应该能找到
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-3-19 19:03:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-19 17:35
你查查各种外文的物化书,里面讲反应速率这块应该能找到

恩恩,好的,那我试试吧,谢谢老师的指点,老师要是有的话,发我一份哦,不是拿来主义,是我不是行家,不知道怎么找。我先自己试试。

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发表于 Post on 2018-2-7 17:26:28 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 suntree 于 2018-10-26 10:21 编辑

看了楼上的帖子,收获很大

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发表于 Post on 2018-5-7 20:42:39 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2015-11-16 01:40
我的理解:

1. 把反应路径里的所有中间体画出来。

李老师您好,我用您说的这种方法来找到了多步反应的决速步骤,并用此步的能量值与初始产物的差值(也就是您说的TS-A)来比较不同反应路径的反应发生难易程度。但审稿人的回复信中提到“All the figures should be corrected due to the wrong energy barriers expression. In principle, the energy can be thought of as the height of the energy barrier separating two minima of potential energy (of the reactants and products of a reaction).” 我在文章中对能垒的叙述确实不太准确,但是不知道该如何表达整条路径的“能垒”。老师有什么好的建议么?

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发表于 Post on 2018-6-29 00:59:48 | 只看该作者 Only view this author

老师 用21kcal/mol为标准判断室温下反应性,如果链接势能面各个中间体的基元反应自由能垒都小于21kcal/mol,但是按照找决速步的通用方法找出的决速步显示自由能垒大于21kcal/mol,是不是应该判定反应在室温下不好发生?

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发表于 Post on 2018-6-29 15:28:50 | 只看该作者 Only view this author
steven 发表于 2018-6-29 00:59
老师 用21kcal/mol为标准判断室温下反应性,如果链接势能面各个中间体的基元反应自由能垒都小于21kcal/mo ...

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发表于 Post on 2018-9-24 10:07:53 | 只看该作者 Only view this author
请问前三种情况,算反应速率时,处理正向能垒有什么不同?什么情况下用TS的能量 - (A的能量+A的能量) 什么情况下用TS的能量-(AB络合物的能量)
谢谢,真的很小白(课题组没人做这个,完全自己抹黑)

微信图片_20180924100341.jpg (111.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 95)

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发表于 Post on 2019-4-26 13:52:54 | 只看该作者 Only view this author

l5 是T6的前期络合物,还是T5的产物呢?是这两种物质中能量低的吗?

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发表于 Post on 2019-4-26 13:59:47 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 15whyhq 于 2019-4-26 14:01 编辑

这种图是每个中间体都是与孤立的反应物作为起点计算的吗?意思就是每个中间体的能量减去起点的能量得到这个中间体的相应的数值,然后标在图上。

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发表于 Post on 2019-4-26 19:40:50 | 只看该作者 Only view this author

为什么不把第一步的产物和第二步的前期络合物都画呢?看这图只画了这两个物质中其中的一个。

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发表于 Post on 2019-4-27 01:19:35 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2019-4-26 13:59
这种图是每个中间体都是与孤立的反应物作为起点计算的吗?意思就是每个中间体的能量减去起点的能量得到这 ...

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