CP2K第一性原理程序在Linux中的安装方法

samplex_aaa

可以在cp2k官方库下载网站：https://www.cp2k.org/static/downloads/下载所需的库文件，避免**上网那一步。但是安装cp2k 24.3版本的时候如果增加d4色散矫正安装就会报错，提示cmake file 不存在，去掉d4色散矫正之后一切正常。。。。不太清楚为什么

samplex_aaa

samplex_aaa 发表于 2024-11-10 18:29
可以在cp2k官方库下载网站：https://www.cp2k.org/static/downloads/下载所需的库文件，避免**上网那一步。 ...

我可能明白了，安装d4色散矫正的话，还是需要喂屁N的。。。。我不太会在linux上搞这个，逐年放弃D4了。。。。

牧生

samplex_aaa 发表于 2024-11-14 20:52
我可能明白了，安装d4色散矫正的话，还是需要喂屁N的。。。。我不太会在linux上搞这个，逐年放弃D4了。。 ...

http://bbs.keinsci.com/thread-47650-1-1.html

这个帖子有解决办法的啊，不需要特殊上网

samplex_aaa

牧生 发表于 2024-11-14 21:25
http://bbs.keinsci.com/thread-47650-1-1.html

这个帖子有解决办法的啊，不需要特殊上网

谢谢！！

南北多歧路

牧生 发表于 2024-11-14 21:25
http://bbs.keinsci.com/thread-47650-1-1.html

这个帖子有解决办法的啊，不需要特殊上网

您好按照该帖子提示这么操作后，似乎还是不太行。还是报mctc-lib库的问题

生煎小馒头

sob老师您好，想请教您一个问题，为什么我编译cp2k2024.3的时候带上用这个参数./install_cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no --with-openmpi=install --with-plumed=install --with-intel=no前面都可以编译成功，但是到了编译本体的时候会出现报错并且编译不出popt：                                                                  
-D__COMPILE_DATE="\"Mon Dec 16 19:14:17 CST 2024\"" -D__COMPILE_HOST="\"login4\"" -D__COMPILE_REVISION="\"git:6712648\"" -D__DATA_DIR="\"/data0/software/cp2k/cp2k-2024.3/data\"" -D__SHORT_FILE__="\"qs_block_davidson_types.F\"" -I'/data0/software/cp2k/cp2k-2024.3/src/' -I'/data0/software/cp2k/cp2k-2024.3/obj/local/psmp/exts/dbcsr' qs_block_davidson_types.F90
/usr/bin/ld: cannot find -lcosma_prefixed_pxgemm
/usr/bin/ld: cannot find -lcosma
collect2: error: ld returned 1 exit status
make[3]: *** [/data0/software/cp2k/cp2k-2024.3/exe/local/dbt_tas_unittest.psmp] Error 1                                                                                                      
而我用这个参数./install_cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no --with-openmpi=install --with-plumed=install --with-intel=no --with-cosma=no来编译，却可以成功编译出ssmp sdbg psmp pdbg:                                                                                                                                                                                                      -Wl,--start-group -lmkl_gf_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core -lmkl_blacs_openmpi_lp64 -Wl,--end-group -lpthread -lm -ldl -lvori -lstdc++ -lstdc++
cd /data0/software/cp2k/cp2k-2024.3/exe/local; ln -sf cp2k.psmp cp2k_shell.psmp
cd /data0/software/cp2k/cp2k-2024.3/exe/local; ln -sf cp2k.psmp cp2k.popt
[root@login4 cp2k-2024.3]# ls exe/local/
cp2k.pdbg        dbm_miniapp.pdbg       dbt_unittest.sdbg  grid_miniapp.pdbg      libcp2k_unittest.sdbg           parallel_rng_types_unittest.pdbg
cp2k.popt        dbm_miniapp.psmp       dbt_unittest.ssmp  grid_miniapp.psmp      libcp2k_unittest.ssmp           parallel_rng_types_unittest.psmp
cp2k.psmp        dbm_miniapp.sdbg       dumpdcd.pdbg       grid_miniapp.sdbg      memory_utilities_unittest.pdbg  parallel_rng_types_unittest.sdbg
cp2k.sdbg        dbm_miniapp.ssmp       dumpdcd.psmp       grid_miniapp.ssmp      memory_utilities_unittest.psmp  parallel_rng_types_unittest.ssmp
cp2k_shell.pdbg  dbt_tas_unittest.pdbg  dumpdcd.sdbg       grid_unittest.pdbg     memory_utilities_unittest.sdbg  xyz2dcd.pdbg
cp2k_shell.psmp  dbt_tas_unittest.psmp  dumpdcd.ssmp       grid_unittest.psmp     memory_utilities_unittest.ssmp  xyz2dcd.psmp
cp2k_shell.sdbg  dbt_tas_unittest.sdbg  graph.pdbg         grid_unittest.sdbg     nequip_unittest.pdbg            xyz2dcd.sdbg
cp2k_shell.ssmp  dbt_tas_unittest.ssmp  graph.psmp         grid_unittest.ssmp     nequip_unittest.psmp            xyz2dcd.ssmp
cp2k.sopt        dbt_unittest.pdbg      graph.sdbg         libcp2k_unittest.pdbg  nequip_unittest.sdbg
cp2k.ssmp        dbt_unittest.psmp      graph.ssmp         libcp2k_unittest.psmp  nequip_unittest.ssmp                                
向您请教一下不加这个cosma库影响大吗?

sobereva

生煎小馒头 发表于 2024-12-16 19:48
sob老师您好，想请教您一个问题，为什么我编译cp2k2024.3的时候带上用这个参数./install_cp2k_toolchain.sh ...

可以不带COSMA库

cl2024_chn

感谢sob老师的详细讲解，有机会学习一下，刚好学校以前买过软件包

牧生

cl2024_chn 发表于 2024-12-23 10:01
感谢sob老师的详细讲解，有机会学习一下，刚好学校以前买过软件包

啥学校啊，花钱买开源免费软件。

正文第一句话就说了免费

1. CP2K（https://www.cp2k.org）是非常好、功能强大的第一性原理程序，开源免费

复制代码

牧生

https://github.com/cp2k/cp2k/releases/tag/v2025.1  

2025.1发布了

链接: https://pan.baidu.com/s/1hpcBUdEc8uvVGAGIXvsSmw?pwd=r9qh 提取码: r9qh 复制这段内容后打开百度网盘手机App，操作更方便哦

e-Lis

在第一步
“运行以下命令
cd /sob/cp2k-8.1/tools/toolchain/
./install_cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no --with-openmpi=install --with-plumed=install”

报了如下错误，不太理解是什么原因导致的，想请各位老师帮忙看一下。

sobereva

e-Lis 发表于 2025-4-16 21:38
在第一步
“运行以下命令
cd /sob/cp2k-8.1/tools/toolchain/

给提示中的文件用chmod加上可执行权限。还不行的话不用并行编译试试

roosterpan

请问出现这样的error应该怎么处理

sobereva

roosterpan 发表于 2025-4-23 22:39
请问出现这样的error应该怎么处理

OpenBLAS包不完整，重新下

roosterpan

sobereva 发表于 2025-4-24 18:23
OpenBLAS包不完整，重新下

好的，谢谢老师！