高斯opt+freq 总是出现中断好久，输出文件中两部分normal termination

万卷书万里路 · 发表于 Post on 2015-11-18 10:18:45

1. 高斯优化结构算频率，这些天算的分子都出现这种情况，

······
FoFDir/FoFCou used for L=0 through L=2.
End of G2Drv Frequency-dependent properties file 721 does not exist.
End of G2Drv Frequency-dependent properties file 722 does not exist.
在这里停好久，快一夜了，这是怎么回事呢？每次都在一个类似的xxxxxxx721 does not exist 停很久是什么原因
2. 还有，明明算了一个白天近十个小时，最后得到输出文件，打开，点summary，居然显示CPU工作计算了2个多小时，查了下输出文件，第一个termination的时间是七个多小时，第二个是两个多小时，summary只显示最后一个的时间，前一个过程的时间为什么不加上？

3. 输出文件里有两个normal ternination，第一次看到，是高斯把什么工作分开做了，不太懂

4. 还想问一下用电脑算的话，对于要知道分子的homo、lumo，是不是把opt和freq分开来算，先opt了结构，再算freq验证一下比较好，还是直接opt freq一起，哪一个更省时间呢

输入文件： # opt freq b3lyp/6-31g(d)
这一次优化的的分子也在图片里

hcxytpp@163.com · 发表于 Post on 2015-11-18 10:27:11

Opt+Freq就是两个步骤啊，先优化输入结构，然后在优化好的结构上算频率，link的啊；homo-Lumo和一起算还是分开算没啥关系吧？

你的任务在运行啊，频率计算本来就耗时，不是停了，是还在继续算，停了是要么报错，要么正常结束的，至于那时间，我也没有研究过

万卷书万里路 · 发表于 Post on 2015-11-18 10:59:48

hcxytpp@163.com 发表于 2015-11-18 10:27
Opt+Freq就是两个步骤啊，先优化输入结构，然后在优化好的结构上算频率，link的啊；homo-Lumo和一起算还是 ...

这样啊，谢谢！还有个问题，opt+freq正常结束之后的输出文件判断是否是能量最低的结构，一个是看振动频率没有虚频，另一个是看output file里靠后的地方最大力常数、位移啥的，应该有四个YES的吧，我看了没有虚频，但是只有三个yes，那这个结果还能认为是最优的吗？

万卷书万里路 · 发表于 Post on 2015-11-18 11:00:05

hcxytpp@163.com 发表于 2015-11-18 10:27
Opt+Freq就是两个步骤啊，先优化输入结构，然后在优化好的结构上算频率，link的啊；homo-Lumo和一起算还是 ...

这样啊，谢谢！还有个问题，opt+freq正常结束之后的输出文件判断是否是能量最低的结构，一个是看振动频率没有虚频，另一个是看output file里靠后的地方最大力常数、位移啥的，应该有四个YES的吧，我看了没有虚频，但是只有三个yes，那这个结果还能认为是最优的吗？

brothers · 发表于 Post on 2015-11-18 11:02:50

http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=633

hcxytpp@163.com · 发表于 Post on 2015-11-18 11:05:05

brothers 发表于 2015-11-18 11:02
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=633

嘿嘿

brothers · 发表于 Post on 2015-11-18 11:14:42

hcxytpp@163.com 发表于 2015-11-18 11:05
嘿嘿

这么风骚的图搭配上嘿嘿一笑，让我有点把持不住啊

万卷书万里路 · 发表于 Post on 2015-11-18 11:30:21

brothers 发表于 2015-11-18 11:02
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=633

奥看到了，谢谢帮助！

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2015-11-18 14:44:28

本帖最后由 liyuanhe211 于 2015-11-18 14:50 编辑

估计l1002的大概时间去看我在http://bbs.keinsci.com/thread-1912-1-1.html下面的回复，那不是中断，只不过没有输出而已。
命令里always 用#p

别拿GV去看summary，自己读输出文件，GV的summary毛病甚多
为什么CPU时间不加上？因为GV只读最后一个。人家任性。想加一起自己写脚本。不过除非你要做评测，否则加一起也没啥用。

Wall time 10h，CPU time 2h，说明你CPU在干别的事情，而且多半多线程没配置对。

opt freq 和自己先opt 读结构再freq是完全一样的。

万卷书万里路 · 发表于 Post on 2015-11-18 15:16:25

liyuanhe211 发表于 2015-11-18 14:44
估计l1002的大概时间去看我在http://bbs.keinsci.com/thread-1912-1-1.html下面的回复，那不是中断，只不过 ...

谢谢！受教了！
另外您说的“CPU在干别的事情，而且多半多线程没配置对”，是什么意思，线程配置怎么弄，可以让控制cpu只算这个相关的任务不干别的事情吗？

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2015-11-18 15:30:26

万卷书万里路发表于 2015-11-18 15:16
谢谢！受教了！
另外您说的“CPU在干别的事情，而且多半多线程没配置对”，是什么意思，线程配置怎么弄 ...

跑任务的时候看看任务管理器里CPU都在干什么。

万卷书万里路 · 发表于 Post on 2015-11-18 20:16:17

liyuanhe211 发表于 2015-11-18 15:30
跑任务的时候看看任务管理器里CPU都在干什么。

恩，看到了，CPU使用率只有百分之十几，一些进程想结束但是提示拒绝访问

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2015-11-18 20:35:28

万卷书万里路发表于 2015-11-18 20:16
恩，看到了，CPU使用率只有百分之十几，一些进程想结束但是提示拒绝访问

%nprocshared=XX 设对了么

万卷书万里路 · 发表于 Post on 2015-11-18 21:00:42

liyuanhe211 发表于 2015-11-18 20:35
%nprocshared=XX 设对了么

没有这一条···，这里的xx是写百分之多少吗

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2015-11-18 21:11:39

万卷书万里路发表于 2015-11-18 21:00
没有这一条···，这里的xx是写百分之多少吗

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