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楼主 Author: 万卷书万里路
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[Gaussian/gview] 高斯opt+freq 总是出现中断好久,输出文件中两部分normal termination

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-18 21:59:02 | 只看该作者 Only view this author

搜了一下这几个关键词,还是不太懂,能细讲一下吗,关于高斯在调用多少内存多少内存多少线程时速度最快,这里的线程是什么意思,从网上搜到这种从来没有在输入文件里写过的这些:
%NprocShared=xx
%mem=xxxxmb
还有,win系统下速度是不是就是很慢,应该装linux系统吗,
谢谢!

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发表于 Post on 2015-11-18 23:57:27 | 只看该作者 Only view this author
万卷书万里路 发表于 2015-11-18 21:59
搜了一下这几个关键词,还是不太懂,能细讲一下吗,关于高斯在调用多少内存多少内存多少线程时速度最快, ...

一般情况,如果没有其它任务在跑,你CPU有几个物理核心%nproc就设几,机子有n GB内存的话留给系统2GB其它都分配给高斯(%mem)。线程的含义你网上一搜就明白了。
Windows版主要是限制大,网上能找到的都是32bit版g09,最多只能用4个核、约1.5GB内存、16GB硬盘,而Linux版,或者64bit windows版g09没这个限制。计算速度其实和Linux版很相近,但不会比Linux版更快。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2015-11-19 01:23:28 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 liyuanhe211 于 2015-11-19 01:25 编辑
万卷书万里路 发表于 2015-11-18 21:59
搜了一下这几个关键词,还是不太懂,能细讲一下吗,关于高斯在调用多少内存多少内存多少线程时速度最快, ...

能给多少给多少,Win 下用Gaussian(x86)最多用大概1370~1395MB内存,设多了会报错。除了这个限制按Sob说的能给多少给多少。

另外注意别让它用虚拟内存。
除了版本位数,不大能明确指出Linux比Win好在哪儿,但是稍微熟练的用了Linux之后你是不会想回来用Win的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-19 09:27:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-18 23:57
一般情况,如果没有其它任务在跑,你CPU有几个物理核心%nproc就设几,机子有n GB内存的话留给系统2GB其它 ...

知道了,谢谢sob老师~

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-19 09:28:00 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2015-11-19 01:23
能给多少给多少,Win 下用Gaussian(x86)最多用大概1370~1395MB内存,设多了会报错。除了这个限制按Sob ...

好,谢谢老师~

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-19 10:31:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-18 23:57
一般情况,如果没有其它任务在跑,你CPU有几个物理核心%nproc就设几,机子有n GB内存的话留给系统2GB其它 ...

sob老师你好,我查了下性能这些信息,用的机子是i7-4790CPU,3.6GHz,四个内核,8个逻辑处理器,8GB物理内存,总的物理内存7.91GB,可用4.58GB,总虚拟内存15.8GB,可用虚拟内存8.61GB,
后面那两个可用内存那么小是为什么,我什么会有不可用的呢?
那我是不是应该写%nproc=4
                          %mem=2.58还是5.91 ?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-19 10:32:18 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2015-11-19 01:23
能给多少给多少,Win 下用Gaussian(x86)最多用大概1370~1395MB内存,设多了会报错。除了这个限制按Sob ...

老师你好,请问别让他用虚拟内存是什么意思,要怎么做

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发表于 Post on 2015-11-19 11:27:05 | 只看该作者 Only view this author
万卷书万里路 发表于 2015-11-19 10:31
sob老师你好,我查了下性能这些信息,用的机子是i7-4790CPU,3.6GHz,四个内核,8个逻辑处理器,8GB物理 ...


你应当先说明你用的是什么系统
%nproc肯定设4
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-19 11:43:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-19 11:27
你应当先说明你用的是什么系统
%nproc肯定设4

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谢谢老师!

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发表于 Post on 2015-11-19 11:52:04 | 只看该作者 Only view this author
万卷书万里路 发表于 2015-11-19 11:43
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谢谢老师!


%mem=1.5GB
%nproc=4
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发表于 Post on 2015-11-19 13:35:26 | 只看该作者 Only view this author
万卷书万里路 发表于 2015-11-19 10:32
老师你好,请问别让他用虚拟内存是什么意思,要怎么做

我一般会把虚拟内存关了。不关的话,保证分给Gaussian的内存量不超过物理内存的剩余量就差不多(不过这样做有时也会给踢到虚拟内存里,注意观察)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-19 14:59:16 | 只看该作者 Only view this author

好的,谢sob老师

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