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[新手求助] 请各位前辈帮忙看看,计算这个体系选用什么基组比较好

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本帖最后由 FFF 于 2021-7-16 14:34 编辑

学校开学了,计算小白也要开始学习和搬砖了。
在下刚自学高斯的理论计算,学习过论坛里的一些帖子,想请教一下计算这个有机分子选用什么基组比较好?各位前辈们给点意见吧,感谢!
这个内盐分子的结构传上来了,有C N S O这几种元素;归根结底是想计算这个分子的△Est(我觉得应该是先S1态的能量,然后算T1态的能量再相减吧?);精度的要求不是很高,因为是想做辅助说明(因为大多数文章里都算了嘛,emmm...人家做我也得做...),不是单纯地做研究理论计算的;想用G16进行计算。
(我看到这一类文章中基本都是用的b3lyp/6-311g这个基组)

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发表于 Post on 2021-2-26 18:37:41 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 DoubeeTwT 于 2021-2-26 18:39 编辑

  • b3lyp/6-31g(d)做几何优化
  • b3lyp/6-311+g**做单点的自由能计算
上海交通大学计算化学与分子生物信息学实验室
Shanghai JiaoTong University
Computational Chemistry and Molecular Bioinformatics Laboratory

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发表于 Post on 2021-2-26 18:51:04 | 只看该作者 Only view this author
纯有机的体系还是建议用M06-2X/6-31g(d)优化。
其他的计算如果不涉及过渡金属,也建议在M06-2X泛函下做。
没有极化函数的基组不要用。

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发表于 Post on 2021-2-26 19:44:29 | 只看该作者 Only view this author
这个分子的T1怕是会有电荷转移吧,B3LYP可能行不通

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发表于 Post on 2021-2-27 00:42:02 | 只看该作者 Only view this author
好好看
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html
用6-311g纯粹开玩笑。

另外把此文末尾列的必看的博文看了再做计算
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355http://bbs.keinsci.com/thread-4447-1-1.html
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发表于 Post on 2021-2-27 00:43:07 | 只看该作者 Only view this author
我本是个娃娃 发表于 2021-2-26 18:51
纯有机的体系还是建议用M06-2X/6-31g(d)优化。
其他的计算如果不涉及过渡金属,也建议在M06-2X泛函下做。
...

一般有机体系用M06-2X没必要,因为B3LYP-D3(BJ)已经表现很好了,见
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html
用M06-2X不仅耗时更高,还容易出虚频,几何优化和SCF收敛往往还更难
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发表于 Post on 2021-2-27 03:27:50 | 只看该作者 Only view this author
这种盐应该要考虑溶剂效应。多半应该是在极性溶剂里,对结构/激发能影响不小。

泛函的话PBE0-D3(BJ),wB97XD都还是比较靠谱。几何优化基组可以选6-31G*,算得动的话def-tzvp也可以,单点def2-tzvp即可

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发表于 Post on 2021-2-27 09:43:44 | 只看该作者 Only view this author
我说一点……这个分子五元环亚甲基上氢酸性应该很强吧,掉了氢就变成稳定的苯并吲哚体系了,应该注意这个问题。
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-2-27 10:08:42 | 只看该作者 Only view this author
感谢各位前辈的意见,我学习计算一下,有问题再向前辈们请教,感谢

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发表于 Post on 2021-2-27 21:30:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Y30181009 于 2021-2-27 21:33 编辑

sob老师,这种体系算单线态三线态能极差,涉及激发态的结构优化,b3lyp-D3(BJ)可以拿来优化内盐体系的S1或者T1结构吗?

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发表于 Post on 2021-2-27 23:54:35 | 只看该作者 Only view this author
Y30181009 发表于 2021-2-27 21:30
sob老师,这种体系算单线态三线态能极差,涉及激发态的结构优化,b3lyp-D3(BJ)可以拿来优化内盐体系的S1 ...

可以。不过算激发态问题用PBE0普遍更好,虽然并不需要激发态优化和激发能的泛函相同,但相同的话可以少解释。所以我更建议用PBE0-D3(BJ)
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发表于 Post on 2021-2-28 14:32:12 | 只看该作者 Only view this author
Y30181009 发表于 2021-2-27 21:30
sob老师,这种体系算单线态三线态能极差,涉及激发态的结构优化,b3lyp-D3(BJ)可以拿来优化内盐体系的S1 ...

这与是否是内盐毫无关系,主要和你研究的激发态有关系,比如是局域激发态还是电荷转移激发态。是不是内盐对于很多问题都不重要。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2021-2-28 15:14:04 | 只看该作者 Only view this author
明白的更清楚了,谢谢两位老师

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