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[其它程序] GROMOS程序免费了

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以前GROMOS程序都是收费的,今天突然发现已经开源免费了,可以直接注册下载,不需要edu邮箱:http://www.gromos.net

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发表于 Post on 2021-3-6 10:09:33 | 只看该作者 Only view this author
谢谢社长分享!

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发表于 Post on 2021-3-6 14:04:03 | 只看该作者 Only view this author
看这名字是不是和gmx有啥亲缘关系?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-6 20:42:13 | 只看该作者 Only view this author
exity 发表于 2021-3-6 14:04
看这名字是不是和gmx有啥亲缘关系?

GROMACS是90年代初从GROMOS派生出来的,俩程序开发理念不同。GROMACS对速度极为重视,而GROMOS程序的开发者就是GROMOS力场的开发者,看重力场开发。GROMACS里还能看到GROMOS的影子,比如.gro格式就是GROMOS来的。如今GROMACS和GROMOS已经完全脱离关系了,甚至GROMACS有的开发者还想把GROMOS力场都从GROMACS中去掉。
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发表于 Post on 2021-3-7 08:08:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-6 20:42
GROMACS是90年代初从GROMOS派生出来的,俩程序开发理念不同。GROMACS对速度极为重视,而GROMOS程序的开发 ...

所以现在gmx广泛流行也证明了速度对MD软件而言是至关重要的吗?
另外受社长影响,我只用过GAFF和AMBER系列力场,GROMOS力场有何优劣?社长能否点评一二?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-8 00:23:33 | 只看该作者 Only view this author
exity 发表于 2021-3-7 08:08
所以现在gmx广泛流行也证明了速度对MD软件而言是至关重要的吗?
另外受社长影响,我只用过GAFF和AMBER系 ...

是。而且gmx非常灵活,常用功能都支持得较完善,又开源免费

一般来说没有什么强烈的理由需要特意用GROMOS系列力场,因为用AMBER、CHARMM也照样挺好。GROMOS96系列力场由于是联合原子力场,主要是跑一些CH、CH2、CH3占较大部分的情况,如磷脂膜,耗时比较低,这是个明显好处。
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发表于 Post on 2021-3-28 11:52:43 | 只看该作者 Only view this author
天下武功唯快不破。

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发表于 Post on 2021-9-5 06:30:14 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 喵星大佬 于 2021-9-6 09:00 编辑
sobereva 发表于 2021-3-6 20:42
GROMACS是90年代初从GROMOS派生出来的,俩程序开发理念不同。GROMACS对速度极为重视,而GROMOS程序的开发 ...
有的开发者还想把GROMOS力场都从GROMACS中去掉。

指grompp的时候弹一些yygq的警告

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