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楼主 Author: clark_yang
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[综合交流] 过渡态跑IRC时出现非常规曲线

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发表于 Post on 2021-11-8 11:12:05 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 xxzj 于 2021-11-8 11:16 编辑
zjxitcc 发表于 2021-11-8 10:15
也有可能是单步的协同反应,直接把N-H键加成到C=C双键上,类似[2+2]环加成

老师,但是我跑完IRC,得到的反应物对应的不是A,而是下图TS2中A''的结构,正好相对于A少了一个氢原子,接下来是想计算吉布斯自由能比较反应能垒,但是现在反应物对不上,就差别在一个氢原子,所以想请问老师这样的情况应该如何处理?是计算吉布斯自由能时只计算A,B,TS2,C这几个能量就可以了吗?谢谢您

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发表于 Post on 2021-11-8 11:24:43 | 只看该作者 Only view this author
xxzj 发表于 2021-11-8 11:12
老师,但是我跑完IRC,得到的反应物对应的不是A,而是下图TS2中A''的结构,正好相对于A少了一个氢原子, ...

你说的跟我说的完全不是一码事。我说的是存在另一种反应机理,你说的是在你设想的机理下如何算能垒。风马牛不相及。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2021-12-3 18:44:54 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-11-8 10:15
也有可能是单步的协同反应,直接把N-H键加成到C=C双键上,类似[2+2]环加成

老师,我计算过渡态,得到了两步反应,第一步是烯烃先进攻氮原子,第二步是氮原子脱氢,然后H和烯烃发生加成,这样合理吗?

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