gromacs的增强采样AWH使用方法求助

HZW · 发表于 Post on 2021-3-14 00:49:00

最近看见Berk的一篇文献，里边介绍了在gromacs中使用AWH方法来添加bias来增强采样，也想试试pull一个DNA然后利用AWH计算自由能分布。但是参数一直不对，想问下卢老师以及论坛上的大佬有没有人会设置AWH方法的参数文件。

puzhongji · 发表于 Post on 2021-3-14 07:43:36

建议加上参考文献。

HZW · 发表于 Post on 2021-3-15 17:02:40

Accelerated weight histogram method for exploring free energy landscapes

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[GROMACS] gromacs的增强采样AWH使用方法求助