如何使用AICD程序做非平面分子的诱导环电流密度图？

zhww · 发表于 Post on 2021-3-19 11:24:48

AICD做的诱导环电流图与磁场的方向有关，使用-b 0 0 1定义。如果是非平面分子怎么办？

（1）磁场方向可以用-b 1 1 0这样定义吗？

（2）几何优化的时候选定几个原子在一个平面上，让磁场垂直穿过也可以，但是几何优化如何保证几个原子在一个平面上？

wangzhe · 发表于 Post on 2021-3-19 14:55:12

(1) 可以
(2) 没看懂你想表达的意思

ps：可以通过三个原子定义一个平面，然后求该平面的法向量用作磁场方向

sobereva · 发表于 Post on 2021-3-19 18:41:50

几何优化完之后，把结构载入Multiwfn，进入主功能300的子功能7，选择10 Make the plane defined by selected atoms parallel to a Cartesian plane，然后输入一批原子，此时程序会旋转体系，使得根据这批原子拟合的平面平行于某个笛卡尔平面。之后再设磁场矢量就方便了

zhww · 发表于 Post on 2021-3-19 20:21:47

谢谢二位！！！

乐平 · 发表于 Post on 2022-4-2 11:23:36

sobereva 发表于 2021-3-19 12:41
几何优化完之后，把结构载入Multiwfn，进入主功能300的子功能7，选择10 Make the plane defined by selecte ...

接着这个问题再问一下 Sob 老师。

如果体系是多个接近平面的结构连接而成的，如下图所示。

这种情况是不是需要分别计算 a, b, c 每个小片段的 AICD 呢？
如果是分别计算，如何将这些结果整合到一个图中呢？

sobereva · 发表于 Post on 2022-4-3 20:34:35

乐平发表于 2022-4-2 11:23
接着这个问题再问一下 Sob 老师。

如果体系是多个接近平面的结构连接而成的，如下图所示。

是。
分别绘图，裁切出各自部分，ps到一起，图注里说明情况

乐平 · 发表于 Post on 2022-4-3 21:42:06

sobereva 发表于 2022-4-3 14:34
是。
分别绘图，裁切出各自部分，ps到一起，图注里说明情况

谢谢 Sob 老师的解答

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[波函数分析求助] 如何使用AICD程序做非平面分子的诱导环电流密度图？

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