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[GROMACS] gromacs如何作膜距离为X轴的水密度分布图

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本帖最后由 王珑霏 于 2021-3-31 14:38 编辑

像这种水密度与膜距离的图怎么画呢?gmx density 命令好像是不能画的
    gmx density 的话是这样吗

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发表于 Post on 2021-3-31 11:37:43 | 只看该作者 Only view this author
做个水的密度分布,再做个膜的密度分布,然后对照着两个图修改一下坐标轴就可以了
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发表于 Post on 2021-3-31 12:26:57 | 只看该作者 Only view this author
gmx density完全可以
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-31 14:22:34 | 只看该作者 Only view this author
Lacrimosa 发表于 2021-3-31 11:37
做个水的密度分布,再做个膜的密度分布,然后对照着两个图修改一下坐标轴就可以了

用gmx density吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-31 14:23:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-31 12:26
gmx density完全可以

用那个命令就可以吗?我试了几次都出不来

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发表于 Post on 2021-3-31 15:27:51 | 只看该作者 Only view this author
王珑霏 发表于 2021-3-31 14:23
用那个命令就可以吗?我试了几次都出不来


用法不当。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-31 15:37:00 | 只看该作者 Only view this author

是哪里有问题呢,希望老师能够指点一下,麻烦老师啦

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-31 16:27:36 | 只看该作者 Only view this author

盒子划分的不对吗

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