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[任务提交/队列管理] 提交作业一直排队

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楼主
       最近几天往学校的数科院服务器上投作业,一直在qw,不运行,类似的作业之前也算过,2-3天的样子就出来结果了。现在却不知道怎么回事。咨询学校的另外一个老师,他的作业可以投并且运行。这是为什么啊?求高人指点!谢谢!

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发表于 Post on 2015-11-25 19:25:01 | 只看该作者 Only view this author
我以前也遇到这个情况,提交作业,就是算不了,1:你看看你的脚本有没有什么问题。
2: 就是检查一下是否有空余的节点,以及你设置的节点数和核数是否合适,比如 我们学校一般要求用12的整数倍,然而,有的同学每次都用8,这样很浪费资源;
3:别人能交能算而你不能的问题:我一个账户只能同时运行5个作业,多了就要排队,有些作业趋势不对,我需要qdel任务然后重新提交,一般在qdel的同时,提交一个新的任务,新得到运行的几率更大。
4:你可以把作业qdel,重新提交看看
废话很多,希望对你有帮助

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真诚相待,淡淡相处,方天久地长^^

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-25 20:12:16 | 只看该作者 Only view this author
我qdel过了,但还是没用啊,把作业传给别的同学(一个院 的),可以计算。但是就我这里不能计算。所以输入文件没问题(脚本指输入文件吧?)我提交的作业也不多,2个。

如何检查空余节点呢?

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发表于 Post on 2015-11-25 20:45:48 | 只看该作者 Only view this author
2833982824 发表于 2015-11-25 20:12
我qdel过了,但还是没用啊,把作业传给别的同学(一个院 的),可以计算。但是就我这里不能计算。所以输入 ...

脚本指SGE/PBS任务提交脚本,不是输入文件。需要在文件中指明所用核数之类的。如果你不知道有这个东西可能是管理人员写好了给你自动生成了。看任务排序系统的具体要求,比如输入文件中必须存在%nprocshared之类的。另外检查是否超过了你可以使用的最大资源,核数,内存

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-25 20:53:10 | 只看该作者 Only view this author
谢谢答复!请教PBS指的是?我的输入文件中指定了%nproc,%mem

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发表于 Post on 2015-11-25 21:28:42 | 只看该作者 Only view this author
2833982824 发表于 2015-11-25 20:53
谢谢答复!请教PBS指的是?我的输入文件中指定了%nproc,%mem

你们的scheduler是什么软件,PBS是其中一种。
我只是举个例子,这种case by case甚至很难在别的电脑上重复出来的问题,只有能看到你电脑的人+配置你们scheduler的老师才容易解决

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发表于 Post on 2015-11-26 19:45:51 | 只看该作者 Only view this author
如果是pbs的话 可以用tracejob 命令查看一下作业信息

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