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[CP2K] cp2k做电荷密度差分时显示 cubecruncher.x: command not found

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楼主
请问各位老师,在用cp2k做两个结构电荷密度的差分时,在同一个文件夹放置了两个结构的cube文件和cubecruncher.x 插件,且插件已赋予可执行权限,但是在在进行电荷密度差分时输入了命令
cubecruncher.x -i name1-ELECTRON_DENSITY-1_0.cube -subtract name2-ELECTRON_DENSITY-1_0.cube -o MODE1_delta.cube
一直显示 bash: cubecruncher.x: command not found...
请问一下是什么原因呢

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发表于 Post on 2021-4-21 12:49:57 | 只看该作者 Only view this author
看清楚板块再发贴,求助帖别发到“资源分享”子版块。这次给你移动了,下次直接删帖处理
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2021-4-21 12:50:51 | 只看该作者 Only view this author
没必要用cubecruncher.x。Multiwfn的格点数据处理功能远比cubecruncher.x强大得多得多,还不用记忆任何命令和选项
看Multiwfn手册4.13.2节格点文件运算例子
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发表于 Post on 2022-3-27 10:01:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-4-21 12:49
看清楚板块再发贴,求助帖别发到“资源分享”子版块。这次给你移动了,下次直接删帖处理

请问一下sob老师,CP2K怎么计算变形电荷密度,

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发表于 Post on 2022-3-27 10:54:44 | 只看该作者 Only view this author
liudong123 发表于 2022-3-27 10:01
请问一下sob老师,CP2K怎么计算变形电荷密度,

如果用的比如Gaussian里就有的6-31G*,把CP2K的molden文件当Multiwfn输入文件,按照下文的方法做就完了,计算期间用到的原子的6-31G*基组下的原子波函数文件调用Gaussian产生
使用Multiwfn作电子密度差图
http://sobereva.com/113
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