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[Lammps] 求助,reaxFF运行时总是自动生成CHO_example.trj,很占磁盘内存,请问如何避免?

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楼主
我的reaxFF运行的in文件是根据lammps中的trj文件改的
运行时总是自动生成CHO_example.trj,这个文件很大,很占磁盘内存。想请问应该如何修改in文件才能避免生成这个文件?

in文件如下:
# REAX potential for CHO system
# .....

units        real
atom_style    charge
read_data    Polypf5Anneal.data

pair_style    reax/c lmp_control
pair_coeff    * * ffield.reax.cho  C H O

neighbor    2 bin
neigh_modify    every 10 delay 0 check no

fix   1 all nvt temp 3500.0 3500.0 100.0
fix   2 all qeq/reax 1 0.0 10.0 1.0e-6 param.qeq
fix   4 all reax/c/species 1 100 100 species.out element C H O
velocity all create 3500 428459 dist gaussian

timestep    0.25
thermo  4000

dump        1 all atom 4000 3500nvt.lammpstrj
run        2000000



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发表于 Post on 2021-4-25 09:05:17 | 只看该作者 Only view this author
lmp_control后面加NULL

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发表于 Post on 2021-4-25 18:22:10 | 只看该作者 Only view this author
lmp_control文件里面的参数write_freq 可以更输出trj的频率,常用参数官方手册都有写。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-9 15:38:40 | 只看该作者 Only view this author
复前行79 发表于 2021-4-25 18:22
lmp_control文件里面的参数write_freq 可以更输出trj的频率,常用参数官方手册都有写。

谢谢!用这个方法解决了

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发表于 Post on 2021-9-6 09:30:25 | 只看该作者 Only view this author
请问用VMD可以打开CHO_example.trj吗,CHO_example.trj是什么格式的轨迹文件?

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发表于 Post on 2021-9-6 10:52:23 | 只看该作者 Only view this author
xinxinup 发表于 2021-9-6 09:30
请问用VMD可以打开CHO_example.trj吗,CHO_example.trj是什么格式的轨迹文件?

改.trj后缀为.xyz试试
真·探

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7#
发表于 Post on 2021-9-15 16:53:31 | 只看该作者 Only view this author
hdhxx123 发表于 2021-9-6 10:52
改.trj后缀为.xyz试试

换成.xyz的还是不行,从CHO_example.trj这个输出文件能获得什么信息呢?

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8#
发表于 Post on 2021-9-15 23:37:19 | 只看该作者 Only view this author
xinxinup 发表于 2021-9-15 16:53
换成.xyz的还是不行,从CHO_example.trj这个输出文件能获得什么信息呢?

轨迹信息,如果不可以可能是输出的信息不规范或者是VMD安装的问题,改成.xyz应该是可以直接拖到VMD的main窗口载入的
真·探

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