Mxene和碳纳米管如何建模？用什么软件

雪见容馥 · 发表于 Post on 2021-4-29 10:58:27

想构建下图的模型，由Mxene的Ti3C2和碳纳米管组成，有-O、-OH、-F官能团随机分布在表面，向各位大佬请教以下问题：
1、如何构建这个模型，用什么软件比较合适？2、对于此体系，计算吸附能结合能弱相互作用之类的，gaussian能否算的动？选用什么方法和基组比较合适？

jiangning198511 · 发表于 Post on 2021-4-29 11:21:08

孤立体系的话用gaussview，如果是周期性的话 MS好一些

雪见容馥 · 发表于 Post on 2021-4-29 12:12:26

jiangning198511 发表于 2021-4-29 11:21
孤立体系的话用gaussview，如果是周期性的话 MS好一些

用gaussview的话Ti3C2和碳纳米管要怎么画？导入外部的cif文件吗？

喵星大佬 · 发表于 Post on 2021-4-29 12:20:12

管子用nanotubemodeler，简单得很

雪见容馥 · 发表于 Post on 2021-4-29 15:07:29

喵星大佬发表于 2021-4-29 12:20
管子用nanotubemodeler，简单得很

我看那个只能生成C-C单键的

喵星大佬 · 发表于 Post on 2021-4-29 15:10:07

雪见容馥发表于 2021-4-29 15:07
我看那个只能生成C-C单键的

然后是随便找个软件，不管是GV还是MS都可以，把原子替换了不就好了。。。。

sobereva · 发表于 Post on 2021-4-29 16:00:04

雪见容馥发表于 2021-4-29 15:07
我看那个只能生成C-C单键的

量化计算完全无视你设的键，只看坐标

nanotube modeler又免费又易用，上面的官能团之后你用gview手动画上去就完了

这种大小体系Gaussian用DFT优化起来会极为费劲。要求不高的话可以xtb优化，然后ORCA算单点，这样最划算。Gaussian算单点也可以，但性价比低得多。

雪见容馥 · 发表于 Post on 2021-4-29 20:04:32

喵星大佬发表于 2021-4-29 15:10
然后是随便找个软件，不管是GV还是MS都可以，把原子替换了不就好了。。。。

好的，明白了

雪见容馥 · 发表于 Post on 2021-4-29 20:05:17

sobereva 发表于 2021-4-29 16:00
量化计算完全无视你设的键，只看坐标

nanotube modeler又免费又易用，上面的官能团之后你用gview手动 ...

了解了，谢谢社长

ymeng · 发表于 Post on 2021-5-10 15:29:26

想求一下这篇文献可以吗？

雪见容馥 · 发表于 Post on 2021-5-11 09:09:49

ymeng 发表于 2021-5-10 15:29
想求一下这篇文献可以吗？

这不是文献，是我们自己的课题

ymeng · 发表于 Post on 2021-5-11 14:43:47

雪见容馥发表于 2021-5-11 09:09
这不是文献，是我们自己的课题

嗦嘎，我们最近也在做mxene

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[新手求助] Mxene和碳纳米管如何建模？用什么软件