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楼主 Author: 大肥猫
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[新手求助] 对一个室温自发发生的异构化,算出势垒32.1kcal/mol是否合理?

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发表于 Post on 2021-5-11 12:44:48 | 只看该作者 Only view this author
大肥猫 发表于 2021-5-10 19:25
您好,我试了,您说的这个二面角的扫描明显是不合理的额。。。

3-4双键的两侧各有一个-CH2,TSa只完成了一个-CH2的翻转,所以应该得到一个中间体,然后另一个-CH2再翻转生成产物,也就是说分两步进行,还有一个TS。但能垒确实是这么高无法改变。

可以先试试转另一个-CH2,可能也是分两步完成,但说不定能垒会低一些。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-11 16:35:24 | 只看该作者 Only view this author
fatpig 发表于 2021-5-11 12:44
3-4双键的两侧各有一个-CH2,TSa只完成了一个-CH2的翻转,所以应该得到一个中间体,然后另一个-CH2再翻转 ...

问题确实是您说的这样,TSa是第一个过渡态,在它后面有一个比它能量略低0.5kcal/mol的另一个CH2翻转的TSb, 但从初始物A到Tsa或Tsb的能垒大于30是无法改变了。。。。好高啊,感觉算出来的结果和实验现象不符,自发反应的能垒应该低于25才合理吧。。。。哭

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-12 16:10:37 | 只看该作者 Only view this author
fatpig 发表于 2021-5-11 12:44
3-4双键的两侧各有一个-CH2,TSa只完成了一个-CH2的翻转,所以应该得到一个中间体,然后另一个-CH2再翻转 ...

您好,问题成功解决!感谢您非常有用的建议~从另一侧CH2优先翻转算出来的第一步过渡态是15kcal/mol, 第二步CH2翻转过渡态是10kcal/mol, 说明靠近芳环的这个CH2如果先翻转理论上是不合理的能垒太高。

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发表于 Post on 2021-5-12 20:40:41 | 只看该作者 Only view this author
大肥猫 发表于 2021-5-12 16:10
您好,问题成功解决!感谢您非常有用的建议~从另一侧CH2优先翻转算出来的第一步过渡态是15kcal/mol, 第二 ...

我也是猜的,但通常来说尽量把其他可能性都试一下,就会看出一些问题。

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发表于 Post on 2021-5-12 21:15:40 | 只看该作者 Only view this author
ms860309 发表于 2021-5-11 01:33
你給我的AB居然轉了180度
難怪我跑得出來

请问您这个图是用什么软件画的?

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发表于 Post on 2021-5-12 21:30:50 | 只看该作者 Only view this author
AndrewX 发表于 2021-5-12 21:15
请问您这个图是用什么软件画的?

pyGSM畫的
可以看我發的帖子

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