计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 13122|回复 Reply: 9
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[VASP] 请问做结构优化的时候如何固定二面角

[复制链接 Copy URL]

16

帖子

0

威望

832

eV
积分
848

Level 4 (黑子)

各位老师好,请问做结构优化的时候如何固定二面角,得到类似附件能量随二面角变化的曲线?

微信截图_20210526135623.png (195.92 KB, 下载次数 Times of downloads: 38)

微信截图_20210526135623.png

646

帖子

1

威望

5254

eV
积分
5920

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2021-5-26 15:12:55 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 北大-陶豫 于 2021-5-26 16:46 编辑

柔性扫描
详谈使用Gaussian做势能面扫描 http://sobereva.com/474

现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124703

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2021-5-27 04:36:49 | 只看该作者 Only view this author
你真要拿VASP算这种体系?
VASP算分子体系太烂了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

646

帖子

1

威望

5254

eV
积分
5920

Level 6 (一方通行)

4#
发表于 Post on 2021-5-27 09:13:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-27 04:36
你真要拿VASP算这种体系?
VASP算分子体系太烂了

啊,哪里看出来要用vasp了
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

76

帖子

0

威望

470

eV
积分
546

Level 4 (黑子)

5#
发表于 Post on 2021-5-27 14:42:30 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2021-5-27 09:13
啊,哪里看出来要用vasp了

发在了vasp的板块里

16

帖子

0

威望

832

eV
积分
848

Level 4 (黑子)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-27 17:03:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-27 04:36
你真要拿VASP算这种体系?
VASP算分子体系太烂了

好吧,只用过vasp

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124703

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2021-5-27 22:34:29 | 只看该作者 Only view this author

向“好吧”作为句子开头宣战!
http://bbs.keinsci.com/thread-334-1-1.html

拿VASP算这种东西让内行一看就极度业余,就像喝汤不用勺子非要用筷子
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

1万

帖子

0

威望

9740

eV
积分
21936

Level 6 (一方通行)

8#
发表于 Post on 2021-5-28 00:01:26 | 只看该作者 Only view this author

孤立的、不是太小的有机分子,适合用高斯、ORCA等软件来算。VASP基本上只适合算固体和表面。
需要用VASP算分子只有一种情况,就是你研究一个分子在表面上的吸附,因为计算吸附能之类的,需要减去孤立分子的能量,又因为理论级别统一的要求,孤立分子必须和表面用同一个软件、同样的计算方法,这时用VASP算分子是合理的。或者比如说你算cohesive energy,需要减去原子的能量,这个原子用VASP算,是合理的。其他情况基本不要用VASP算孤立的分子、原子。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

16

帖子

0

威望

832

eV
积分
848

Level 4 (黑子)

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-28 10:32:58 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-5-28 00:01
孤立的、不是太小的有机分子,适合用高斯、ORCA等软件来算。VASP基本上只适合算固体和表面。
需要用VASP ...

是的,的确是要算表面自组装

16

帖子

0

威望

832

eV
积分
848

Level 4 (黑子)

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-28 10:34:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-27 22:34
向“好吧”作为句子开头宣战!
http://bbs.keinsci.com/thread-334-1-1.html

抱歉,下次不会了。用vasp是想算表面自组装。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-1-25 17:45 , Processed in 0.225633 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list