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[GROMACS] pdb2gmx命名中-ter的意思不是很理解

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本人操作用到命令如下:gmx pdb2gmx -f KALP-15_princ.pdb -o KALP-15_processed.gro -ignh -ter -water spc
其中中的 -ter ,查询官网手册说是-ter: Interactively assign charge states for N- and C-termini. 这里我该怎么理解呢?

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发表于 Post on 2021-5-28 03:43:34 | 只看该作者 Only view this author
就是让你设置末端残基怎么处理,要求处理时pdb2gmx根据tdb文件相应地处理





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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-28 10:07:48 | 只看该作者 Only view this author
好的好的! 理解了! 谢谢老师!

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