求助：关于CPMD的编译选项问题

yoghurt117 · 发表于 Post on 2021-5-28 00:19:05

本帖最后由 yoghurt117 于 2021-5-28 00:22 编辑

单机编译CPMD的时候，会出现下面几个相似的选项，前三个一般怎么选择呢？有什么区别没有，今天都试着编译了一下，倒是都成功了，不知道什么区别，运行时间上都差不多。
LINUX-AMD64-INTEL-MPI
LINUX-INTEL-INTELMPI
LINUX-X86_64-INTEL-MPI
LINUX-X86_64-INTEL-IMPI-FFTW
第四个是加入FFTW库的，前面三个怎么选择？谢谢
我装的是intel parallel xe2019，用的cpmd4.3，这个版本的编译相对来说简单点，比3.x方便多了。

下面是编译过程中出现的问题，我都记录了，有编译出类似问题的可以看看参考。
1. C编译器选项的问题，记得mint和ubuntu编译的时候会出现下面的错误，
<https://www.gnu.org/licenses/>.  */
-----------------------------------^
kinds.mod.f90(20): error #5145: Invalid blank/tab
include it implicitly at the start of every compilation.  It must
-----------------------------------------------------------^
..............
kinds.mod.f90(36): error #5145: Invalid blank/tab
/* wchar_t uses Unicode 10.0.0.  Version 10.0 of the Unicode Standard is
-------------------------------^
kinds.mod.f90(1): catastrophic error: Could not recover from previous syntax error
compilation aborted for kinds.mod.f90 (code 1)
make[1]: *** [/home/mint/soft/cpmd/code/4.3/CPMD//Makefile:123: kinds.mod.o] Error 1
make[1]: *** Waiting for unfinished jobs....
make[1]: Leaving directory '/home/mint/soft/cpmd/code/4.3/CPMD/obj'
make: *** [Makefile:84: default,] Error 2

网上查了查，是编译器选项的问题，只需要将下列CPP中的-C去掉即可，即将：
CPP = /usr/bin/cpp -P -C -traditional
修改为：
CPP = /usr/bin/cpp -P  -traditional

2.mpif90的问题，忘了是哪个configure.sh的选项了，使用mpif90编译的时候报错，改为mpiifort就可以，但是出现下面的错误，
ld: warning: libfabric.so.1, needed by /home/mint/intel/compilers_and_libraries_2019.3.199/linux/mpi/intel64/lib/release/libmpi.so, not found (try using -rpath or -rpath-link)
网上查了查，使用-rpath或者-rpath-link选项将：
LFLAGS = -static-intel -mkl=sequential
修改为
LFLAGS = -static-intel -mkl=sequential  -rpath=/home/mint/intel/impi/2019.3.199/intel64/libfabric/lib
即可，这里的/home/mint/intel/impi/2019.3.199/intel64/libfabric/lib是我机器的libfabric目录，大家按照自己机器的libfabric目录修改

3. -mkl的问题，忘了是LINUX-AMD64-INTEL-MPI，LINUX-INTEL-INTELMPI，LINUX-X86_64-INTEL-MPI，LINUX-X86_64-INTEL-IMPI-FFTW这里哪个了，生成的Makefile里面编译选项为：
LFLAGS = -static-intel -mkl=serial
将其修改为：
LFLAGS = -static-intel -mkl=sequential
就可以通过，serial应该是串行的

4.libfftw3_mpi的问题，编译的时候提示错误：
ld: cannot find -lfftw3_mpi
网上查了查，在安装fftw的时候使用--enable-mpi就可以生成libfftw3_mpi.a，可以在LFLAG中添加为：
LFLAGS = -static-intel -mkl=sequential -L/home/mint/soft/cp2k/cp2k-7.1/tools/toolchain/install/fftw-3.3.8/lib/libfftw3_mpi.a
(在线编译过cp2k，直接用的cp2k的)

jiangning198511 · 发表于 Post on 2021-5-28 09:06:48

好像目前CP2K的使用率比CPMD的高，楼主使用CPMD是想用CPMD的什么功能？

yoghurt117 · 发表于 Post on 2021-5-28 09:34:22

jiangning198511 发表于 2021-5-28 09:06
好像目前CP2K的使用率比CPMD的高，楼主使用CPMD是想用CPMD的什么功能？

其实就是想用cp动力学算点东西，然后想抽空学学pimd的计算，目前在用水分子为例学习，小范围的研究

哥们你呢?

jiangning198511 · 发表于 Post on 2021-5-28 10:09:08

yoghurt117 发表于 2021-5-28 09:34
其实就是想用cp动力学算点东西，然后想抽空学学pimd的计算，目前在用水分子为例学习，小范围的研究

哥 ...

我之前试着用CP2K算过一些DFT计算，同实验室的跑过一些AIMD的计算，他们也说CP2K速度很快，版本更新也快，并且例子多，也有论坛。而CPMD基本没啥动静了，感觉大有被CP2K取代的趋势

sobereva · 发表于 Post on 2021-5-28 10:10:26

CPMD大势已去，基本上CPMD能干的CP2K都能干，Hutter的开发重心都转移到CP2K去了，现在学CPMD有点49年入国军的意思

yoghurt117 · 发表于 Post on 2021-5-28 10:44:55

sobereva 发表于 2021-5-28 10:10
CPMD大势已去，基本上CPMD能干的CP2K都能干，Hutter的开发重心都转移到CP2K去了，现在学CPMD有点49年入国军 ...

额.....

好吧

cpmd确实使用不方便，cp2k的确功能很多，算的很快，但是cp2k编译总出问题

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