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[综合交流] 使用Gaussian计算这个有机分子的拉曼信号时的基组以及泛函选择问题

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本帖最后由 LIEXINGWUGUANG 于 2021-5-31 09:11 编辑


计算新手,想要用Windows的32位Gaussian 09计算这个分子的拉曼信号,第四行的写法是
“#p opt freq=Raman B3LYP/6-311+G**”
计算出的结果与实验结果相差很多,3000 cm-1左右的峰的强度比实验结果高很多,而0-1500 cm-1的峰则是弱了很多,请问是我的基组和泛函的选择有问题吗?

b17eca8065380cd7670cf961a444ad3459828128.png (20.02 KB, 下载次数 Times of downloads: 37)

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发表于 Post on 2021-5-31 09:13:37 | 只看该作者 Only view this author
这可能是拉曼活性和拉曼强度的问题,一般实验拉曼光谱是表面增强共振拉曼光谱,需要给样品一个激发光。你可以用 Multiwfn 处理拉曼计算的输出文件,在 Multiwfn 里输出激发光波长后生成拉曼强度的图后再和实验比较。

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发表于 Post on 2021-5-31 12:15:37 | 只看该作者 Only view this author
仔细看此文了解怎么正确地绘制拉曼光谱
使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-Vis、ECD、VCD和ROA光谱图
http://sobereva.com/224

计算级别没显著问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-31 12:25:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-31 12:15
仔细看此文了解怎么正确地绘制拉曼光谱
使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-Vis、ECD、VCD和ROA光谱图
http: ...

谢谢,关于Multiwfn的使用这方面我倒是还没了解过,可以尝试了解一下(虽然我本人并不是做计算的,这个也只是在能自己动手的时候自己动手算省得找人还麻烦而已,不过多学一些总没有坏处)。请问,有推荐的Multiwfn的使用教程之类的文章吗?http://sobereva.com/167(Multiwfn入门tips)、http://sobereva.com/452(Multiwfn FAQ)和http://sobereva.com/184(Multiwfn波函数分析程序的意义、功能与用途)足够吗

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发表于 Post on 2021-5-31 13:16:46 | 只看该作者 Only view this author
LIEXINGWUGUANG 发表于 2021-5-31 12:25
谢谢,关于Multiwfn的使用这方面我倒是还没了解过,可以尝试了解一下(虽然我本人并不是做计算的,这个也 ...

看Multiwfn的官方手册(1000+页),里面有大量的实例,你可以选择你感兴趣的章节阅读和操练
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发表于 Post on 2021-5-31 15:34:25 | 只看该作者 Only view this author
实验是在溶液里测的吧?建议考虑一下溶剂效应。
另外高斯虽然能算出每个峰的相对积分面积,但是算不出峰宽,所以你看到的图是在假设每个峰都一样宽的情况下画出来的,如果你跟实验比峰高,就容易有很大误差。可以试试改成比峰面积。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2021-6-1 04:14:06 | 只看该作者 Only view this author
LIEXINGWUGUANG 发表于 2021-5-31 12:25
谢谢,关于Multiwfn的使用这方面我倒是还没了解过,可以尝试了解一下(虽然我本人并不是做计算的,这个也 ...

把《Multiwfn入门tips》仔细看了就不可能再问这种问题。与其什么都不看就提问,不如赶快看博文得到答案更快
Multiwfn差不多1000页的手册、上百万字的Multiwfn相关博文还不够看的?
Multiwfn每年还有专门的培训班,讲义2300多页(http://www.keinsci.com/workshop/WFN_content.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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