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[GROMACS] 求助:模拟Li离子溶剂化构型的力场

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老师们好,我想要模拟加了磷酸三乙酯的锂电电解液里Li离子的溶剂化构型,并计算配位数,用GAFF力场的时候发现,第一个峰出现在2埃左右,用OPLS-AA时发现第一个峰出现在3点多埃处,请问为什么会有这样的差异啊,我应该选择哪个力场比较正确啊,谢谢老师了

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OPLS-AA

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GAFF

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发表于 Post on 2021-6-4 00:21:40 | 只看该作者 Only view this author
按说应该是GAFF好一点吧。Li离子可以用Merz的参数

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发表于 Post on 2021-6-4 09:02:00 | 只看该作者 Only view this author
这种问题适合Merz或者KBFF力场里的离子参数。Merz力场在弄的时候还专门检验了配位数的计算情况。GAFF、OPLS-AA那些一般向力场里的离子参数相对来说都比较糙

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