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[新手求助] 计算离子液体否需要考虑BSSE和弥散函数?

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楼主
请教一下大家,我在计算离子液体1-乙基-3-甲基咪唑硝酸盐(AB)催化有机中性分子丙酮(C)反应时,有下面3个疑问:

1.计算离子液体1-乙基-3-甲基咪唑硝酸盐(AB)的形成能即阳离子(A+)和阴离子(B-)的结合能(E = EAB - EA - EB)时需要考虑BSSE吗(或者说怎么判断是静电还是色散作用为主)?此外计算离子液体AB的能量是否需要加弥散函数(这里阴离子B-可能局部带负电荷,而整个体系AB又是中性的)?
2.离子液体AB与有机中性分子C相互作用(结构优化)进行BSSE校正时,把AB作为一个片段、C作为一个片段对不对?

2.离子液体AB与有机中性分子C相互作用(结构优化)时,A+在C的上方,B-在C的下方这种构型合理吗?还是说在空间结构上A+与B-不能离的太远?

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发表于 Post on 2021-6-16 17:37:31 | 只看该作者 Only view this author
1. 对于非共价复合物,是否需要考虑BSSE只和分子大小、基组大小以及你需要的精度有关,而和这个相互作用是否以色散为主无关。比如两个大小类似的复合物,复合物A以色散为主,复合物B以静电为主,那么一般而言复合物B的结合能要明显更大,但是两个复合物的BSSE差不多大。有人会告诉你说,以静电为主的复合物不是太需要考虑BSSE,但那是因为BSSE对静电复合物的结合能的相对误差影响比较小(因为静电复合物的结合能一般比较大),对绝对误差的影响不随复合物相互作用的静电性质多少而改变。
2. 如果你确定,一个A和一个B就能描述你想描述的性质,那么可以。但是一般而言,溶剂里的性质用一两个溶剂分子可能是无法合理描述的,同理对于离子液体,也必须先确定,一个阳离子和一个阴离子到底够不够描述你想描述的性质。
3. 应当做构型搜索来确认这一点。一般除非C和离子液体有比较强的相互作用,否则最稳定的构型A和B应该是彼此接触的。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-16 17:57:07 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-6-16 17:37
1. 对于非共价复合物,是否需要考虑BSSE只和分子大小、基组大小以及你需要的精度有关,而和这个相互作用是 ...

非常感谢!您的意思是如果精度要求不高,离子液体(是静电复合物?)计算不需要考虑BSSE?阴离子计算需要加弥散,那计算离子液体整体的时候需要加吗?

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发表于 Post on 2021-6-16 18:12:57 | 只看该作者 Only view this author
一般都需要考虑BSSE。阴离子部分带显著负电荷,显然得带弥散,而且本来算弱相互作用能就应当带弥散函数,更是必须带弥散不可,而且是所有原子除了氢以外都要加弥散

此文明确说了
谈谈弥散函数和“月份”基组
http://sobereva.com/119
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-17 08:03:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-6-16 18:12
一般都需要考虑BSSE。阴离子部分带显著负电荷,显然得带弥散,而且本来算弱相互作用能就应当带弥散函数,更 ...

好的,谢谢sob老师

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发表于 Post on 2021-11-16 16:00:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-6-16 18:12
一般都需要考虑BSSE。阴离子部分带显著负电荷,显然得带弥散,而且本来算弱相互作用能就应当带弥散函数,更 ...

老师,如果我使用B3LYP/def2-TZVP对离子液体进行几何优化,然后计算AIM、分子体积和分子表面积需要考虑加弥散吗?
钱塘江上潮信来,今日方知我是我。

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发表于 Post on 2021-11-17 02:13:36 | 只看该作者 Only view this author
晓滨MD 发表于 2021-11-16 16:00
老师,如果我使用B3LYP/def2-TZVP对离子液体进行几何优化,然后计算AIM、分子体积和分子表面积需要考虑加 ...

不用
应当用B3LYP-D3(BJ)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-11-17 12:29:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-11-17 02:13
不用
应当用B3LYP-D3(BJ)

好的,谢谢老师
钱塘江上潮信来,今日方知我是我。

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