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[NAMD] 请问一下隐性溶剂和郎之万控温是否冲突的问题

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楼主
郎之万控温通过阻尼系数模拟温度的变化,而隐性溶剂失去了显性的溶剂分子,失去了局部摩擦,那么我是否可以认为它没有阻尼,二者也不兼容,求教

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发表于 Post on 2021-6-27 13:03:49 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 k64_cc 于 2021-6-27 15:56 编辑

Langevin里的阻尼不是真的阻尼,它本质上还是对canonical ensemble的采样,和用MC是一样的。不会和隐式溶剂不兼容。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-27 16:46:13 | 只看该作者 Only view this author
k64_cc 发表于 2021-6-27 13:03
Langevin里的阻尼不是真的阻尼,它本质上还是对canonical ensemble的采样,和用MC是一样的。不会和隐式溶剂 ...

懂了,谢谢老师

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