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[GROMACS] 关于多链蛋白相互作用的pmf计算问题

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楼主
请问两个多链蛋白相互作用时候
其中一个蛋白某个链和另外一个蛋白某个链结合的PMF可以用gromacs分组功能实现分别的能量计算么?

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2#
发表于 Post on 2021-12-29 16:15:36 | 只看该作者 Only view this author
求问题主问题解决了吗?同样遇到蛋白质复合物多个链的问题,是每个链当成独立的molecule分开计算吗?然后要怎么把结果合并呢?因为想看的是整个复合物整体的结构变化

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