“第25届北京科音初级量子化学培训班” 将于6月11至14日于北京举办,是初学者真正从头一次性完整、系统性学习量子化学计算,从而能很快上手量子化学研究的重要机会,比起自己摸索、鼓捣能少走无数弯路。报名正在进行中,请点击此链接查看,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 8384|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Amber] 求助:关于-ref选项的问题

[复制链接 Copy URL]

140

帖子

0

威望

860

eV
积分
1000

Level 4 (黑子)

请问-ref选项后指定的参考坐标文件一定要匹配-c选项后的文件吗?我现在就是需要指定另一个构象做参考,但是一旦-ref和-c指定的文件不匹配就会报错:FATAL: NATOM mismatch in constraint coord and topology files


求助各位大佬要怎么解决?我需要另一个构象作为target MD的目标构像。

88

帖子

0

威望

2400

eV
积分
2488

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2021-7-2 23:41:59 | 只看该作者 Only view this author
ref 是指要參考的座標檔案必須與 crd 檔案裡面的東西依樣..除了座標等等不同..

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-6-11 01:50 , Processed in 0.357410 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list