一个难收敛体系给大家收敛着玩儿

hebrewsnabla · 发表于 Post on 2021-7-1 21:28:38

hdhxx123 发表于 2021-7-1 21:24
老师，具体的参数是只要修改一个cavity=……即可吗

哦我记错了，应该是这样的格式，写在gjf末尾

复制代码

N是额外cavity数目，也就是配体原子数目。下面需要逐行写上所有额外cavity的坐标（X Y Z）和半径。
另外scrf里面需要增加一个read

hdhxx123 · 发表于 Post on 2021-7-1 22:04:47

hebrewsnabla 发表于 2021-7-1 21:28
哦我记错了，应该是这样的格式，写在gjf末尾

N是额外cavity数目，也就是配体原子数目。下面需要逐行 ...

补充一下：
1.ExtraSph=N与下面的X Y Z radius间空一行
2.radius采用uff半径

hdhxx123 · 发表于 Post on 2021-7-4 09:53:44

hebrewsnabla 发表于 2021-7-1 21:28
哦我记错了，应该是这样的格式，写在gjf末尾

N是额外cavity数目，也就是配体原子数目。下面需要逐行 ...

老师，这个现在是正经问题了

加了这个溶剂腔之后收敛性明显下降了。。。现在真收敛不了了，gjf和out文件在附件中

hdhxx123 · 发表于 Post on 2021-7-5 15:06:23

上面那个解决了，又来一个神奇不收敛。。。

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[综合交流] 一个难收敛体系给大家收敛着玩儿