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[CP2K] 关于DZVP-MOLOPT-GTH和DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组混用

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大家下午好,
目前基于cp2k做包含Si、Ca、F、OP、B、Al等元素在内凝聚态体系的AIMD。
选用基组的过程中,考虑到由于DZVP-MOLOPT-GTH基组仅涵盖H , C , N , O , F , Si , P , S , Cl元素,而DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组覆盖了元素周期表绝大部分元素,
如果计算的体系中还包含H , C , N , O , F , Si , P , S , Cl之外的元素,请问是都用DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组,还是部分元素用DZVP-MOLOPT-GTH基组,缺的元素用DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组?哪种方案更好?

谢谢大家百忙之中抽出时间解答!
两个对易的厄米算子可以有共同本征函数集

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发表于 Post on 2021-7-5 22:26:06 | 只看该作者 Only view this author
周期性体系用SR挺合适的

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发表于 Post on 2021-7-6 08:38:45 | 只看该作者 Only view this author
都用DZVP-MOLOPT-SR-GTH就可以
不带SR的更贵,对于AIMD来说没有额外的好处

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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发表于 Post on 2025-5-13 20:17:52 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 JCenter 于 2025-5-13 20:19 编辑
sobereva 发表于 2021-7-6 08:38
都用DZVP-MOLOPT-SR-GTH就可以
不带SR的更贵,对于AIMD来说没有额外的好处

卢老师,我的体系含有C H O  N S Na,600原子左右,跑FPMD,体系内含有钠离子,以及硫酸根、氢氧根等阴离子。由于体系有钠离子,我使用全电子基组方法GAPW+混合基组(PBE纯泛函)的策略,并且除钠离子,阴离子中O以外的原子使用常用的DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组,以降低Na的截断能值。针对于混合基组设置,想请教您几个问题
1.对钠元素使用全电子基组时,哪种更合适搭配DZVP-MOLOPT-SR-GTH赝式基组呢,6-31g**还是pob-dzvp-rev2呢
2.阴离子(氢氧根和硫酸根)中的O原子使用短程DZVP-MOLOPT-SR-GTH还是长程DZVP-MOLOPT-GTH合适呢,您之前说过短程的DZVP-MOLOPT-SR-GTH也带有一定的弥散,并且周期性不能随便考虑弥散问题,毕竟不是孤立体系。
3.假设以上不同的部分都已经确定相应的基组,cp2k里使用这么多混合基组在发表文章时会被揪着问吗
目前专攻:
基于DFT、MD模拟的自由能计算
基于过渡态理论的自由能垒和反应速率常数计算
基于MD模拟的交联聚合物计算

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发表于 Post on 2025-5-13 23:33:48 | 只看该作者 Only view this author
JCenter 发表于 2025-5-13 20:17
卢老师,我的体系含有C H O  N S Na,600原子左右,跑FPMD,体系内含有钠离子,以及硫酸根、氢氧根等阴离子 ...

1 pob-dzvp-rev2
2 DZVP-MOLOPT-GTH
3 不会,除非碰到菜鸟审稿人
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2025-5-13 23:52:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-5-13 23:33
1 pob-dzvp-rev2
2 DZVP-MOLOPT-GTH
3 不会,除非碰到菜鸟审稿人

感谢卢老师
目前专攻:
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基于过渡态理论的自由能垒和反应速率常数计算
基于MD模拟的交联聚合物计算

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