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楼主 Author: sobereva
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[Gaussian/gview] Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-12 19:57:39 | 只看该作者 Only view this author
daodaoliu 发表于 2017-6-12 18:38
(3)中得到的发射波长误差接近50nm,因此,又继续考虑溶剂的影响,继续往下做了(4)中的第一步,log文件中 ...


如果你是指的4.5节,特定态模型下算荧光只做第一步原理上不行。就算结果恰好不错,那也只是误差抵消的巧合
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发表于 Post on 2017-6-12 20:19:35 | 只看该作者 Only view this author
请问sob老师,我用gaussian对某个分子的几个构象进行优化和振动频率并分析结果,发现两个构象的HF能量值和结构是一样,但计算ECD理论图谱又不一样(方法相同),请问是什么问题?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-13 00:13:55 | 只看该作者 Only view this author
qcn 发表于 2017-6-12 20:19
请问sob老师,我用gaussian对某个分子的几个构象进行优化和振动频率并分析结果,发现两个构象的HF能量值和 ...


完全相同结构,完全相同关键词,完全相同的程序,算出来的ECD不可能不同
如果确信满足上述条件但结果的确不同,把输出文件压缩后上传
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发表于 Post on 2017-6-13 09:32:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-6-13 00:13
完全相同结构,完全相同关键词,完全相同的程序,算出来的ECD不可能不同
如果确信满足上述条件但结果 ...

sob老师,附件是我说的结构相同,但ECD理论光谱不同的例子,请帮忙看看问题出在哪里?

结构相同,ECD光谱不同.zip

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结构相同,ECD理论光谱不同

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-13 12:02:10 | 只看该作者 Only view this author
qcn 发表于 2017-6-13 09:32
sob老师,附件是我说的结构相同,但ECD理论光谱不同的例子,请帮忙看看问题出在哪里?


结构不相同啊,一个ECD输出文件里,体系有一半是平面的,而另一个输出文件里,体系那一半是非平面的,ECD显然不同。
包括你做几何优化的初猜结构都不同
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发表于 Post on 2017-6-13 12:36:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-6-13 12:02
结构不相同啊,一个ECD输出文件里,体系有一半是平面的,而另一个输出文件里,体系那一半是非平面的,E ...

非常谢谢sob老师的解惑。请问用构象搜索软件的分子立场方法进行构象搜索后,接着进行结构优化,如何准确判定两个构象完全相同?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-13 12:42:46 | 只看该作者 Only view this author
qcn 发表于 2017-6-13 12:36
非常谢谢sob老师的解惑。请问用构象搜索软件的分子立场方法进行构象搜索后,接着进行结构优化,如何准确 ...

用molclus里的isostat判断很方便,看
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=577
gentor:扫描方式做分子构象搜索的便捷工具
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发表于 Post on 2017-6-13 17:27:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-6-13 12:42
用molclus里的isostat判断很方便,看
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsc ...

谢谢sob老师。

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发表于 Post on 2017-6-14 15:21:56 | 只看该作者 Only view this author
谢谢分享~!

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发表于 Post on 2017-6-14 22:49:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-6-12 19:57
如果你是指的4.5节,特定态模型下算荧光只做第一步原理上不行。就算结果恰好不错,那也只是误差抵消的 ...

按照4.5节的方法完成了整个计算,只是最后一次的计算命令用的是
#P Pbe1pbe/6-31g* scrf=(solvent=generic,read)
因为输入文件是由上一步计算结果的log文件通过gview生成的,所以去掉了例子里面的geom=check guess=read。
完成基态计算后也得到了基态能量。
sob老师,这样做也是可以的吧?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-16 01:03:52 | 只看该作者 Only view this author
daodaoliu 发表于 2017-6-14 22:49
按照4.5节的方法完成了整个计算,只是最后一次的计算命令用的是
#P Pbe1pbe/6-31g* scrf=(solvent=gener ...

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发表于 Post on 2017-7-15 20:17:01 | 只看该作者 Only view this author
我做构象优化,其中有一个构象不收敛,对这个构象用GDIIS或calcfc优化,假如收敛,这个构象的单点能和激发能与其它构象在默认条件下得到的单点能和激发能有可比性吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-7-16 00:18:25 | 只看该作者 Only view this author
qcn 发表于 2017-7-15 20:17
我做构象优化,其中有一个构象不收敛,对这个构象用GDIIS或calcfc优化,假如收敛,这个构象的单点能和激发 ...

有可比性
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发表于 Post on 2017-7-16 10:14:15 | 只看该作者 Only view this author
谢谢sob 老师

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发表于 Post on 2017-7-26 16:17:07 | 只看该作者 Only view this author
在做完sob 老师的例子 (4.5 基于特定态溶剂模型做TDDFT计算)后. 想按照g09 的例子再做一次,
但去到打破对称 (break symmetry) 那个部分就做不下了. 不用打破对称的话算不出 "Excited State 1: Singlet-A 3.2074 eV 386.55 nm", 都变成了330.55nm.

但用了opt=readfc 跟geom=modify 都会有错误.
想问一下如果要打破对称的话是不是, 乱动一下基态优化后的样子比较好?

本版积分规则 Credits rule

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