求助：运行gmx mdrun出错

1971806673 · 发表于 Post on 2021-7-17 11:23:09

老师，您好，我在Linux系统下运行命令：gmx mdrun -v -deffnm mdaf，显示这样的错误：Step 0 Warning: pressure scaling more than 1%, mu: -3.05688e+25 -3.05688e+25 -3.05688e+25step 0Warning: Triclinic box is too skewed. 详细内容我截屏上传了，希望老师可以看一下，谢谢老师。

sobereva · 发表于 Post on 2021-7-17 15:12:14

没细节没法说，至少提供初始的gro文件和mdp

1971806673 · 发表于 Post on 2021-7-17 20:14:22

老师，您好，我将npt.gro文件截图（文件太大无法上传），索引文件（加速组和冻结组）、mdaf.mdp文件上传给您了，麻烦老师您看一下，谢谢您老师。

jiajh · 发表于 Post on 2021-7-25 17:35:57

这个忙有点儿大~

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[GROMACS] 求助：运行gmx mdrun出错

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