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[GROMACS] 求助：伞形采样中npt模拟初始温度过高的问题

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发表于 Post on 2021-7-20 10:59:04 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励

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在进行Umbrella Sampling时，对抽取得到的构型进行npt模拟，发现存在初始温度过高的问题，如附件中日志文件所示。除此之外，计算过程中也出现WARNING的提示，截图附上。
目前做的检查：在VMD中检查发现构型是没有问题的，尝试减小步长到1fs，仍出现上述情况；计算使用的.gro文件含位置和速度信息。想问问大家导致初始温度过高的问题可能是什么？谢谢各位！

202107201057523140..png (663.38 KB, 下载次数 Times of downloads: 22)

WARNING提示

WARNING提示

202107201042252242..png (17.61 KB, 下载次数 Times of downloads: 25)

log文件中初始温度的提示

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