捐赠本论坛 (Donate this site)
开启辅助访问 切换到宽版

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
在11月21-24日期间，本论坛仅限等级≥level 4的成员发贴，带来的不便请谅解！其他成员若有学术问题请等到能发贴的时候再发帖。此期间不要给管理员sobereva发私信问学术问题
计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 波函数分析与Multiwfn (Wavefunction Analysis & Multiwfn) › 基于TrEsp计算的激子耦合能中出现的计算问题以及对说明 ...
返回列表 Return 发新帖
Views: 5107|回复 Reply: 8
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn使用咨询] 基于TrEsp计算的激子耦合能中出现的计算问题以及对说明书中公式的理解问题

[复制链接 Copy URL]
量化新生

3

帖子

0

威望

71

eV
积分
74

Level 2 能力者
跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
发表于 Post on 2021-7-31 10:31:25 | 只看该作者 Only view this author 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
本帖最后由 量化新生 于 2021-7-31 15:04 编辑

3.8版本的Multiwfn说明书中4.A.9 Calculate TrEsp 3. Evaluating excitonic coupling energy based on TrEsp 补充了基于TrEsp计算的激子耦合能的计算方法以及公式,遇到以下困惑问题一、对于P893的公式，截图示于图一中，V00,00，V00,11和V01,10.是指Multiwfn第7模块的-2指令都可以计算吗。下角标的00,11,10以及01分别代表的什么？以及如何计算？
个人理解01是dimer1中的基态到激发态（S0-S1）的吸收过程，10是dimer中另一个单分子激发态到基态（S1-S0）的发射过程。那在计算激发态那步我们需要如何考虑到这两个过程。这三个库伦能在程序中又是如何操作得到？

二、回到对激子耦合能的计算
具体说明书中步骤示于图2.有以下不理解的地方望指教。
step1. 优化二体结构。想要计算激子耦合能，我们是优化基态的二体结构吗？还是为得到10过程还需要优化激发态的二体结构？
step2. 如果上一步所示优化基态二体结构，这一步将二体拆分可理解。但如果还需计算激发态优化是取一个基态优化的几何结构，取一个激发态的几何结构，分别再做激发态计算吗？

三、我的计算过程以及结果与文献中激子耦合能的对比我计算了Pengqian组的文章中的一个分子DPA激子耦合能，结果我的计算结果要比文献中的大两个量级。具体步骤以及二体结构和文章如下。希望帮助我指出我计算的问题，并请教一下：Multiwfn软件计算的激子耦合能与文献中的激子耦合能是同一个物理量吧？
列出DPA的dimer结构图如下

1.opt freq b3lyp/6-31g(d)  优化二体基态计算
2.# td cam-b3lyp/6-31g(d) density=transition=1 nosymm out=wfn  激发态计算
3.利用.chg文件计算TrESP电荷，电荷如下图所示


4.选择7模块，-2.分子片段。计算结果如下

5.重复的文献以及文献结果
J. Phys. Chem. Lett. 2021, 12, 938-946  
https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpclett.0c03453

不知道怎么能把mol文件上传。只能贴在帖子上了。抱歉
DPA-dimer
  MatStudio         3D                             0
88 96  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
   2.8457    4.4472    9.2755 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.0678    4.9972   10.0174 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.5364    4.4266    8.8087 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   0.8734    4.9552    9.2371 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.1935    3.6392    7.7241 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   0.2965    3.6194    7.4120 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   2.1690    2.8790    7.0967 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.9428    2.3460    6.3436 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.4772    2.8937    7.5647 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   4.1353    2.3666    7.1276 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.8424    3.6709    8.6691 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   5.2422    3.6981    9.1747 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   5.5206    4.1539   10.5062 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   4.7967    4.3605   11.0845 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   6.7930    4.2972   10.9627 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   6.9389    4.6038   11.8497 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   7.9141    3.9943   10.1288 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   7.6567    3.4715    8.8147 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   6.3049    3.3363    8.3790 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   6.1338    2.9856    7.5129 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   9.2303    4.1877   10.5474 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   9.3939    4.5362   11.4161 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   15.1262    0.7712   12.3794 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   14.9041    1.3212   11.6375 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   16.4354    0.7506   12.8461 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   17.0984    1.2792   12.4177 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   16.7783   -0.0368   13.9308 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   17.6753   -0.0566   14.2429 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   15.8028   -0.7970   14.5581 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   16.0291   -1.3300   15.3112 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   14.4947   -0.7823   14.0902 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   13.8365   -1.3094   14.5272 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   14.1295   -0.0051   12.9858 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   12.7296    0.0221   12.4801 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   12.4513    0.4779   11.1487 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   13.1752    0.6845   10.5704 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   11.1789    0.6212   10.6922 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   11.0329    0.9278    9.8052 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   10.0578    0.3183   11.5260 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   10.3151   -0.2045  12.8402 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   11.6670   -0.3397   13.2758 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   11.8381   -0.6904   14.1420 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   8.7415    0.5117   11.1075 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   8.5780    0.8602   10.2388 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  15.1262    2.9048    9.2569 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  14.9041    2.3548    8.5150 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  16.4354    2.9254    9.7236 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  17.0984    2.3968    9.2952 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  16.7783    3.7128   10.8083 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  17.6753    3.7326   11.1204 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  15.8028    4.4730   11.4356 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  16.0291    5.0060   12.1887 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  14.4947    4.4583   10.9677 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  13.8365    4.9854   11.4047 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  14.1295    3.6811    9.8633 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  12.7296    3.6539    9.3576 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  12.4513    3.1981    8.0262 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  13.1752    2.9915    7.4479 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  11.1789    3.0548    7.5697 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  11.0329    2.7482    6.6827 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  10.0578    3.3577    8.4035 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  10.3151    3.8805    9.7177 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  11.6670    4.0157   10.1533 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  11.8381    4.3664   11.0195 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  8.7415    3.1643    7.9850 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  8.5780    2.8158    7.1163 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  2.8457   -0.7712   12.3980 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  3.0678   -1.3212   13.1399 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.5364   -0.7506   11.9312 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  0.8734   -1.2792   12.3596 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.1935    0.0368   10.8466 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  0.2965    0.0566   10.5345 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  2.1690    0.7970   10.2192 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.9428    1.3300    9.4661 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  3.4772    0.7823   10.6872 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  4.1353    1.3094   10.2501 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  3.8424    0.0051   11.7916 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  5.2422   -0.0221   12.2972 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  5.5206   -0.4779   13.6287 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  4.7967   -0.6845   14.2070 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  6.7930   -0.6212   14.0852 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  6.9389   -0.9278   14.9722 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  7.9141   -0.3183   13.2513 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  7.6567    0.2045   11.9372 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  6.3049    0.3397   11.5015 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  6.1338    0.6904   10.6354 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  9.2303   -0.5117   13.6699 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  9.3939   -0.8602   14.5386 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  2  1  1  0  0  0   3  1  4  0  0  0
  4  3  1  0  0  0
  5  3  4  0  0  0
  6  5  1  0  0  0
  7  5  4  0  0  0
  8  7  1  0  0  0
  9  7  4  0  0  0
10  9  1  0  0  0
11  1  4  0  0  0
11  9  4  0  0  0
12 11  1  0  0  0
13 12  4  0  0  0
14 13  1  0  0  0
15 13  4  0  0  0
16 15  1  0  0  0
17 15  4  0  0  0
18 17  4  0  0  0
19 18  4  0  0  0
19 12  4  0  0  0
20 19  1  0  0  0
21 17  4  0  0  0
22 21  1  0  0  0
18 65  4  0  0  0
24 23  1  0  0  0
25 23  4  0  0  0
26 25  1  0  0  0
27 25  4  0  0  0
28 27  1  0  0  0
29 27  4  0  0  0
30 29  1  0  0  0
31 29  4  0  0  0
32 31  1  0  0  0
33 23  4  0  0  0
33 31  4  0  0  0
34 33  1  0  0  0
35 34  4  0  0  0
36 35  1  0  0  0
37 35  4  0  0  0
38 37  1  0  0  0
39 37  4  0  0  0
40 39  4  0  0  0
41 40  4  0  0  0
41 34  4  0  0  0
42 41  1  0  0  0
43 39  4  0  0  0
44 43  1  0  0  0
40 87  4  0  0  0
46 45  1  0  0  0
47 45  4  0  0  0
48 47  1  0  0  0
49 47  4  0  0  0
50 49  1  0  0  0
51 49  4  0  0  0
52 51  1  0  0  0
53 51  4  0  0  0
54 53  1  0  0  0
55 45  4  0  0  0
55 53  4  0  0  0
56 55  1  0  0  0
57 56  4  0  0  0
58 57  1  0  0  0
59 57  4  0  0  0
60 59  1  0  0  0
61 59  4  0  0  0
62 61  4  0  0  0
63 62  4  0  0  0
63 56  4  0  0  0
64 63  1  0  0  0
65 61  4  0  0  0
66 65  1  0  0  0
62 21  4  0  0  0
68 67  1  0  0  0
69 67  4  0  0  0
70 69  1  0  0  0
71 69  4  0  0  0
72 71  1  0  0  0
73 71  4  0  0  0
74 73  1  0  0  0
75 73  4  0  0  0
76 75  1  0  0  0
77 67  4  0  0  0
77 75  4  0  0  0
78 77  1  0  0  0
79 78  4  0  0  0
80 79  1  0  0  0
81 79  4  0  0  0
82 81  1  0  0  0
83 81  4  0  0  0
84 83  4  0  0  0
85 84  4  0  0  0
85 78  4  0  0  0
86 85  1  0  0  0
87 83  4  0  0  0
88 87  1  0  0  0
84 43  4  0  0  0
M  END

最后，辛苦大佬们解答疑惑！！！




回复 Reply

举报 Report

量化新生

3

帖子

0

威望

71

eV
积分
74

Level 2 能力者
2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-31 10:33:28 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 量化新生 于 2021-7-31 15:03 编辑

mol文件有一丢丢问题，串行了两个，重新附上
DPA-dimer
  MatStudio         3D                             0
88 96  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
   2.8457    4.4472    9.2755 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.0678    4.9972   10.0174 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.5364    4.4266    8.8087 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   0.8734    4.9552    9.2371 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.1935    3.6392    7.7241 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   0.2965    3.6194    7.4120 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   2.1690    2.8790    7.0967 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.9428    2.3460    6.3436 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.4772    2.8937    7.5647 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   4.1353    2.3666    7.1276 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.8424    3.6709    8.6691 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   5.2422    3.6981    9.1747 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   5.5206    4.1539   10.5062 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   4.7967    4.3605   11.0845 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   6.7930    4.2972   10.9627 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   6.9389    4.6038   11.8497 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   7.9141    3.9943   10.1288 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   7.6567    3.4715    8.8147 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   6.3049    3.3363    8.3790 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   6.1338    2.9856    7.5129 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   9.2303    4.1877   10.5474 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   9.3939    4.5362   11.4161 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   15.1262    0.7712   12.3794 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   14.9041    1.3212   11.6375 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   16.4354    0.7506   12.8461 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   17.0984    1.2792   12.4177 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   16.7783   -0.0368   13.9308 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   17.6753   -0.0566   14.2429 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   15.8028   -0.7970   14.5581 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   16.0291   -1.3300   15.3112 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   14.4947   -0.7823   14.0902 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   13.8365   -1.3094   14.5272 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   14.1295   -0.0051   12.9858 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   12.7296    0.0221   12.4801 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   12.4513    0.4779   11.1487 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   13.1752    0.6845   10.5704 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   11.1789    0.6212   10.6922 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   11.0329    0.9278    9.8052 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   10.0578    0.3183   11.5260 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   10.3151   -0.2045  12.8402 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   11.6670   -0.3397   13.2758 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   11.8381   -0.6904   14.1420 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   8.7415    0.5117   11.1075 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   8.5780    0.8602   10.2388 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  15.1262    2.9048    9.2569 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  14.9041    2.3548    8.5150 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  16.4354    2.9254    9.7236 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  17.0984    2.3968    9.2952 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  16.7783    3.7128   10.8083 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  17.6753    3.7326   11.1204 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  15.8028    4.4730   11.4356 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  16.0291    5.0060   12.1887 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  14.4947    4.4583   10.9677 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  13.8365    4.9854   11.4047 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  14.1295    3.6811    9.8633 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  12.7296    3.6539    9.3576 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  12.4513    3.1981    8.0262 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  13.1752    2.9915    7.4479 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  11.1789    3.0548    7.5697 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  11.0329    2.7482    6.6827 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  10.0578    3.3577    8.4035 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  10.3151    3.8805    9.7177 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  11.6670    4.0157   10.1533 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  11.8381    4.3664   11.0195 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  8.7415    3.1643    7.9850 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  8.5780    2.8158    7.1163 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  2.8457   -0.7712   12.3980 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  3.0678   -1.3212   13.1399 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.5364   -0.7506   11.9312 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  0.8734   -1.2792   12.3596 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.1935    0.0368   10.8466 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  0.2965    0.0566   10.5345 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  2.1690    0.7970   10.2192 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.9428    1.3300    9.4661 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  3.4772    0.7823   10.6872 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  4.1353    1.3094   10.2501 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  3.8424    0.0051   11.7916 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  5.2422   -0.0221   12.2972 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  5.5206   -0.4779   13.6287 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  4.7967   -0.6845   14.2070 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  6.7930   -0.6212   14.0852 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  6.9389   -0.9278   14.9722 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  7.9141   -0.3183   13.2513 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  7.6567    0.2045   11.9372 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  6.3049    0.3397   11.5015 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  6.1338    0.6904   10.6354 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  9.2303   -0.5117   13.6699 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  9.3939   -0.8602   14.5386 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  2  1  1  0  0  0
  3  1  4  0  0  0
  4  3  1  0  0  0
  5  3  4  0  0  0
  6  5  1  0  0  0
  7  5  4  0  0  0
  8  7  1  0  0  0
  9  7  4  0  0  0
10  9  1  0  0  0
11  1  4  0  0  0
11  9  4  0  0  0
12 11  1  0  0  0
13 12  4  0  0  0
14 13  1  0  0  0
15 13  4  0  0  0
16 15  1  0  0  0
17 15  4  0  0  0
18 17  4  0  0  0
19 18  4  0  0  0
19 12  4  0  0  0
20 19  1  0  0  0
21 17  4  0  0  0
22 21  1  0  0  0
18 65  4  0  0  0
24 23  1  0  0  0
25 23  4  0  0  0
26 25  1  0  0  0
27 25  4  0  0  0
28 27  1  0  0  0
29 27  4  0  0  0
30 29  1  0  0  0
31 29  4  0  0  0
32 31  1  0  0  0
33 23  4  0  0  0
33 31  4  0  0  0
34 33  1  0  0  0
35 34  4  0  0  0
36 35  1  0  0  0
37 35  4  0  0  0
38 37  1  0  0  0
39 37  4  0  0  0
40 39  4  0  0  0
41 40  4  0  0  0
41 34  4  0  0  0
42 41  1  0  0  0
43 39  4  0  0  0
44 43  1  0  0  0
40 87  4  0  0  0
46 45  1  0  0  0
47 45  4  0  0  0
48 47  1  0  0  0
49 47  4  0  0  0
50 49  1  0  0  0
51 49  4  0  0  0
52 51  1  0  0  0
53 51  4  0  0  0
54 53  1  0  0  0
55 45  4  0  0  0
55 53  4  0  0  0
56 55  1  0  0  0
57 56  4  0  0  0
58 57  1  0  0  0
59 57  4  0  0  0
60 59  1  0  0  0
61 59  4  0  0  0
62 61  4  0  0  0
63 62  4  0  0  0
63 56  4  0  0  0
64 63  1  0  0  0
65 61  4  0  0  0
66 65  1  0  0  0
62 21  4  0  0  0
68 67  1  0  0  0
69 67  4  0  0  0
70 69  1  0  0  0
71 69  4  0  0  0
72 71  1  0  0  0
73 71  4  0  0  0
74 73  1  0  0  0
75 73  4  0  0  0
76 75  1  0  0  0
77 67  4  0  0  0
77 75  4  0  0  0
78 77  1  0  0  0
79 78  4  0  0  0
80 79  1  0  0  0
81 79  4  0  0  0
82 81  1  0  0  0
83 81  4  0  0  0
84 83  4  0  0  0
85 84  4  0  0  0
85 78  4  0  0  0
86 85  1  0  0  0
87 83  4  0  0  0
88 87  1  0  0  0
84 43  4  0  0  0
M  END
回复 Reply

举报 Report

sobereva

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112349

管理员

公社社长
3#
发表于 Post on 2021-7-31 10:37:10 | 只看该作者 Only view this author
量化新生 发表于 2021-7-31 10:33
mol文件有一丢丢问题，串行了两个，重新附上
DPA-dimer
  MatStudio         3D                         ...

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员必读贴里明确说了
北京科音自然科学研究中心（http://www.keinsci.com）致力于计算化学的发展和传播，长期开办高质量的各种计算化学类培训：初级量子化学培训班、中级量子化学培训班、高级量子化学培训班、量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班、分子动力学与GROMACS培训班、CP2K第一性原理计算培训班，内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路！培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》。
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章！
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”：1号：18616395，2号：466017436，3号：764390338，搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加，合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔，提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog：http://sobereva.com（发布大量原创计算化学相关博文）
Multiwfn主页：http://sobereva.com/multiwfn（十分强大的量子化学波函数分析程序）
ResearchGate：https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!
回复 Reply

举报 Report

量化新生

3

帖子

0

威望

71

eV
积分
74

Level 2 能力者
4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-31 15:06:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-7-31 10:37
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员 ...

抱歉抱歉，我以为发完贴就编辑不了了。不好意思。主要还是望解答疑惑，萌新下次注意
回复 Reply

举报 Report

sobereva

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112349

管理员

公社社长
5#
发表于 Post on 2021-8-1 10:34:37 | 只看该作者 Only view this author
分清楚3.8和3.8(dev)，前者迄今没发布过

一
就是你说的含义。Multiwfn目前只能基于TrESP电荷近似计算，没法按照你截图里那个式子严格按照积分来计算。
怎么算在4.A.9第三部分已经明确描述了，先用Multiwfn算相应跃迁对应的TrESP电荷，再通过TrESP电荷让Multiwfn直接根据库仑公式计算

二
就是优化基态二聚体结构（如果你想计算其它有特殊意义的结构下的激子耦合也可以用其它结构）

三
明显不能直接用B3LYP优化，这是弱相互作用体系最基本的计算常识，仔细看
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557（http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html）

你贴的文件我没法正常载入
mol不可能不能上传，例： a.mol (533 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1) 。
重新用恰当的级别优化、算激发态，如果还有问题，直接上传结构文件我再看


你说的那篇文章我目前没时间看。你可以看看之前一些Multiwfn用户通过Multiwfn算TrESP研究库仑耦合的文章，试图予以重复：
J. Phys. Chem. Lett. 2020, 11, 7908−7913
Chemical Physics https://doi.org/10.1016/j.chemphys.2019.110439
J. Phys. Chem. B 2020, 124, 10653−10662
Phys. Chem. Chem. Phys. DOI: 10.1039/c9cp05753f
NATURE COMMUNICATIONS, (2019) 10, 2048

北京科音自然科学研究中心（http://www.keinsci.com）致力于计算化学的发展和传播，长期开办高质量的各种计算化学类培训：初级量子化学培训班、中级量子化学培训班、高级量子化学培训班、量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班、分子动力学与GROMACS培训班、CP2K第一性原理计算培训班，内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路！培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》。
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章！
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”：1号：18616395，2号：466017436，3号：764390338，搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加，合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔，提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog：http://sobereva.com（发布大量原创计算化学相关博文）
Multiwfn主页：http://sobereva.com/multiwfn（十分强大的量子化学波函数分析程序）
ResearchGate：https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!
回复 Reply

举报 Report

chunlinxxx

57

帖子

0

威望

2026

eV
积分
2083

Level 5 (御坂)
6#
发表于 Post on 2024-11-13 18:09:28 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 chunlinxxx 于 2024-11-13 18:11 编辑

请问老师们，如果只考虑晶体环境，用默认Multiwfn计算需要考虑特定的真空电容率值吗？我看文献公式前面还乘以了一个1/(4πε0)项
回复 Reply

举报 Report

sobereva

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112349

管理员

公社社长
7#
发表于 Post on 2024-11-14 06:03:48 | 只看该作者 Only view this author
chunlinxxx 发表于 2024-11-13 18:09
请问老师们，如果只考虑晶体环境，用默认Multiwfn计算需要考虑特定的真空电容率值吗？我看文献公式前面还乘 ...

Multiwfn用的原子单位，此时没1/(4πε0)项
北京科音自然科学研究中心（http://www.keinsci.com）致力于计算化学的发展和传播，长期开办高质量的各种计算化学类培训：初级量子化学培训班、中级量子化学培训班、高级量子化学培训班、量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班、分子动力学与GROMACS培训班、CP2K第一性原理计算培训班，内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路！培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》。
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章！
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”：1号：18616395，2号：466017436，3号：764390338，搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加，合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔，提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog：http://sobereva.com（发布大量原创计算化学相关博文）
Multiwfn主页：http://sobereva.com/multiwfn（十分强大的量子化学波函数分析程序）
ResearchGate：https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!
回复 Reply

举报 Report

chunlinxxx

57

帖子

0

威望

2026

eV
积分
2083

Level 5 (御坂)
8#
发表于 Post on 2024-11-14 07:50:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-11-14 06:03
Multiwfn用的原子单位，此时没1/(4πε0) ...

谢谢老大。那所得的值默认就是真空吗
回复 Reply

举报 Report

sobereva

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112349

管理员

公社社长
9#
发表于 Post on 2024-11-14 08:16:27 | 只看该作者 Only view this author
chunlinxxx 发表于 2024-11-14 07:50
谢谢老大。那所得的值默认就是真空吗

是

评分 Rate

参与人数
Participants 1		eV +1 收起 理由
Reason
chunlinxxx + 1 谢谢

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心（http://www.keinsci.com）致力于计算化学的发展和传播，长期开办高质量的各种计算化学类培训：初级量子化学培训班、中级量子化学培训班、高级量子化学培训班、量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班、分子动力学与GROMACS培训班、CP2K第一性原理计算培训班，内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路！培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》。
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章！
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”：1号：18616395，2号：466017436，3号：764390338，搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加，合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔，提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog：http://sobereva.com（发布大量原创计算化学相关博文）
Multiwfn主页：http://sobereva.com/multiwfn（十分强大的量子化学波函数分析程序）
ResearchGate：https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!
回复 Reply

举报 Report

返回列表 Return 发新帖

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 00:41 , Processed in 0.210645 second(s), 31 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list