第16届北京科音初级量子化学培训班将于10月3~6日于北京举行,是量子化学初学者迅速、正确上手计算的最佳机会!报名已经开始,请点击此链接查看详情,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码
 现在注册!
查看: 287|回复: 4

[Multiwfn使用咨询] 基于TrEsp计算的激子耦合能中出现的计算问题以及对说明书中公式的理解问题

[复制链接]

3

帖子

0

威望

67

eV
积分
70

Level 2 能力者

发表于 2021-7-31 10:31:25 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 量化新生 于 2021-7-31 15:04 编辑

3.8版本的Multiwfn说明书中4.A.9 Calculate TrEsp 3. Evaluating excitonic coupling energy based on TrEsp 补充了基于TrEsp计算的激子耦合能的计算方法以及公式,遇到以下困惑问题一、对于P893的公式,截图示于图一中,V00,00,V00,11和V01,10.是指Multiwfn第7模块的-2指令都可以计算吗。下角标的00,11,10以及01分别代表的什么?以及如何计算?
个人理解01是dimer1中的基态到激发态(S0-S1)的吸收过程,10是dimer中另一个单分子激发态到基态(S1-S0)的发射过程。那在计算激发态那步我们需要如何考虑到这两个过程。这三个库伦能在程序中又是如何操作得到?
202107301015284453..png
二、回到对激子耦合能的计算
具体说明书中步骤示于图2.有以下不理解的地方望指教。
step1. 优化二体结构。想要计算激子耦合能,我们是优化基态的二体结构吗?还是为得到10过程还需要优化激发态的二体结构?
step2. 如果上一步所示优化基态二体结构,这一步将二体拆分可理解。但如果还需计算激发态优化是取一个基态优化的几何结构,取一个激发态的几何结构,分别再做激发态计算吗?
202107300957355153..png
三、我的计算过程以及结果与文献中激子耦合能的对比我计算了Pengqian组的文章中的一个分子DPA激子耦合能,结果我的计算结果要比文献中的大两个量级。具体步骤以及二体结构和文章如下。希望帮助我指出我计算的问题,并请教一下:Multiwfn软件计算的激子耦合能与文献中的激子耦合能是同一个物理量吧?
列出DPA的dimer结构图如下
202107311024115545..png
1.opt freq b3lyp/6-31g(d)  优化二体基态计算
2.# td cam-b3lyp/6-31g(d) density=transition=1 nosymm out=wfn  激发态计算

3.利用.chg文件计算TrESP电荷,电荷如下图所示
202107311029446306..png 202107311029549168..png

4.选择7模块,-2.分子片段。计算结果如下
202107301020424537..png
5.重复的文献以及文献结果
J. Phys. Chem. Lett. 2021, 12, 938-946  
https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpclett.0c03453
202107301025043066..png
不知道怎么能把mol文件上传。只能贴在帖子上了。抱歉
DPA-dimer
  MatStudio         3D                             0
88 96  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
   2.8457    4.4472    9.2755 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.0678    4.9972   10.0174 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.5364    4.4266    8.8087 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   0.8734    4.9552    9.2371 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.1935    3.6392    7.7241 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   0.2965    3.6194    7.4120 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   2.1690    2.8790    7.0967 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.9428    2.3460    6.3436 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.4772    2.8937    7.5647 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   4.1353    2.3666    7.1276 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.8424    3.6709    8.6691 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   5.2422    3.6981    9.1747 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   5.5206    4.1539   10.5062 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   4.7967    4.3605   11.0845 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   6.7930    4.2972   10.9627 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   6.9389    4.6038   11.8497 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   7.9141    3.9943   10.1288 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   7.6567    3.4715    8.8147 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   6.3049    3.3363    8.3790 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   6.1338    2.9856    7.5129 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   9.2303    4.1877   10.5474 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   9.3939    4.5362   11.4161 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   15.1262    0.7712   12.3794 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   14.9041    1.3212   11.6375 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   16.4354    0.7506   12.8461 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   17.0984    1.2792   12.4177 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   16.7783   -0.0368   13.9308 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   17.6753   -0.0566   14.2429 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   15.8028   -0.7970   14.5581 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   16.0291   -1.3300   15.3112 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   14.4947   -0.7823   14.0902 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   13.8365   -1.3094   14.5272 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   14.1295   -0.0051   12.9858 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   12.7296    0.0221   12.4801 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   12.4513    0.4779   11.1487 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   13.1752    0.6845   10.5704 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   11.1789    0.6212   10.6922 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   11.0329    0.9278    9.8052 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   10.0578    0.3183   11.5260 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   10.3151   -0.2045  12.8402 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   11.6670   -0.3397   13.2758 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   11.8381   -0.6904   14.1420 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   8.7415    0.5117   11.1075 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   8.5780    0.8602   10.2388 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  15.1262    2.9048    9.2569 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  14.9041    2.3548    8.5150 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  16.4354    2.9254    9.7236 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  17.0984    2.3968    9.2952 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  16.7783    3.7128   10.8083 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  17.6753    3.7326   11.1204 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  15.8028    4.4730   11.4356 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  16.0291    5.0060   12.1887 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  14.4947    4.4583   10.9677 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  13.8365    4.9854   11.4047 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  14.1295    3.6811    9.8633 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  12.7296    3.6539    9.3576 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  12.4513    3.1981    8.0262 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  13.1752    2.9915    7.4479 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  11.1789    3.0548    7.5697 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  11.0329    2.7482    6.6827 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  10.0578    3.3577    8.4035 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  10.3151    3.8805    9.7177 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  11.6670    4.0157   10.1533 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  11.8381    4.3664   11.0195 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  8.7415    3.1643    7.9850 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  8.5780    2.8158    7.1163 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  2.8457   -0.7712   12.3980 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  3.0678   -1.3212   13.1399 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.5364   -0.7506   11.9312 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  0.8734   -1.2792   12.3596 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.1935    0.0368   10.8466 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  0.2965    0.0566   10.5345 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  2.1690    0.7970   10.2192 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.9428    1.3300    9.4661 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  3.4772    0.7823   10.6872 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  4.1353    1.3094   10.2501 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  3.8424    0.0051   11.7916 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  5.2422   -0.0221   12.2972 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  5.5206   -0.4779   13.6287 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  4.7967   -0.6845   14.2070 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  6.7930   -0.6212   14.0852 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  6.9389   -0.9278   14.9722 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  7.9141   -0.3183   13.2513 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  7.6567    0.2045   11.9372 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  6.3049    0.3397   11.5015 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  6.1338    0.6904   10.6354 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  9.2303   -0.5117   13.6699 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  9.3939   -0.8602   14.5386 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  2  1  1  0  0  0   3  1  4  0  0  0
  4  3  1  0  0  0
  5  3  4  0  0  0
  6  5  1  0  0  0
  7  5  4  0  0  0
  8  7  1  0  0  0
  9  7  4  0  0  0
10  9  1  0  0  0
11  1  4  0  0  0
11  9  4  0  0  0
12 11  1  0  0  0
13 12  4  0  0  0
14 13  1  0  0  0
15 13  4  0  0  0
16 15  1  0  0  0
17 15  4  0  0  0
18 17  4  0  0  0
19 18  4  0  0  0
19 12  4  0  0  0
20 19  1  0  0  0
21 17  4  0  0  0
22 21  1  0  0  0
18 65  4  0  0  0
24 23  1  0  0  0
25 23  4  0  0  0
26 25  1  0  0  0
27 25  4  0  0  0
28 27  1  0  0  0
29 27  4  0  0  0
30 29  1  0  0  0
31 29  4  0  0  0
32 31  1  0  0  0
33 23  4  0  0  0
33 31  4  0  0  0
34 33  1  0  0  0
35 34  4  0  0  0
36 35  1  0  0  0
37 35  4  0  0  0
38 37  1  0  0  0
39 37  4  0  0  0
40 39  4  0  0  0
41 40  4  0  0  0
41 34  4  0  0  0
42 41  1  0  0  0
43 39  4  0  0  0
44 43  1  0  0  0
40 87  4  0  0  0
46 45  1  0  0  0
47 45  4  0  0  0
48 47  1  0  0  0
49 47  4  0  0  0
50 49  1  0  0  0
51 49  4  0  0  0
52 51  1  0  0  0
53 51  4  0  0  0
54 53  1  0  0  0
55 45  4  0  0  0
55 53  4  0  0  0
56 55  1  0  0  0
57 56  4  0  0  0
58 57  1  0  0  0
59 57  4  0  0  0
60 59  1  0  0  0
61 59  4  0  0  0
62 61  4  0  0  0
63 62  4  0  0  0
63 56  4  0  0  0
64 63  1  0  0  0
65 61  4  0  0  0
66 65  1  0  0  0
62 21  4  0  0  0
68 67  1  0  0  0
69 67  4  0  0  0
70 69  1  0  0  0
71 69  4  0  0  0
72 71  1  0  0  0
73 71  4  0  0  0
74 73  1  0  0  0
75 73  4  0  0  0
76 75  1  0  0  0
77 67  4  0  0  0
77 75  4  0  0  0
78 77  1  0  0  0
79 78  4  0  0  0
80 79  1  0  0  0
81 79  4  0  0  0
82 81  1  0  0  0
83 81  4  0  0  0
84 83  4  0  0  0
85 84  4  0  0  0
85 78  4  0  0  0
86 85  1  0  0  0
87 83  4  0  0  0
88 87  1  0  0  0
84 43  4  0  0  0
M  END

最后,辛苦大佬们解答疑惑!!!




3

帖子

0

威望

67

eV
积分
70

Level 2 能力者

 楼主| 发表于 2021-7-31 10:33:28 | 显示全部楼层
本帖最后由 量化新生 于 2021-7-31 15:03 编辑

mol文件有一丢丢问题,串行了两个,重新附上
DPA-dimer
  MatStudio         3D                             0
88 96  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
   2.8457    4.4472    9.2755 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.0678    4.9972   10.0174 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.5364    4.4266    8.8087 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   0.8734    4.9552    9.2371 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.1935    3.6392    7.7241 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   0.2965    3.6194    7.4120 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   2.1690    2.8790    7.0967 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.9428    2.3460    6.3436 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.4772    2.8937    7.5647 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   4.1353    2.3666    7.1276 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.8424    3.6709    8.6691 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   5.2422    3.6981    9.1747 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   5.5206    4.1539   10.5062 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   4.7967    4.3605   11.0845 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   6.7930    4.2972   10.9627 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   6.9389    4.6038   11.8497 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   7.9141    3.9943   10.1288 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   7.6567    3.4715    8.8147 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   6.3049    3.3363    8.3790 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   6.1338    2.9856    7.5129 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   9.2303    4.1877   10.5474 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   9.3939    4.5362   11.4161 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   15.1262    0.7712   12.3794 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   14.9041    1.3212   11.6375 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   16.4354    0.7506   12.8461 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   17.0984    1.2792   12.4177 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   16.7783   -0.0368   13.9308 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   17.6753   -0.0566   14.2429 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   15.8028   -0.7970   14.5581 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   16.0291   -1.3300   15.3112 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   14.4947   -0.7823   14.0902 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   13.8365   -1.3094   14.5272 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   14.1295   -0.0051   12.9858 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   12.7296    0.0221   12.4801 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   12.4513    0.4779   11.1487 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   13.1752    0.6845   10.5704 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   11.1789    0.6212   10.6922 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   11.0329    0.9278    9.8052 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   10.0578    0.3183   11.5260 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   10.3151   -0.2045  12.8402 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   11.6670   -0.3397   13.2758 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   11.8381   -0.6904   14.1420 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   8.7415    0.5117   11.1075 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   8.5780    0.8602   10.2388 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  15.1262    2.9048    9.2569 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  14.9041    2.3548    8.5150 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  16.4354    2.9254    9.7236 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  17.0984    2.3968    9.2952 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  16.7783    3.7128   10.8083 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  17.6753    3.7326   11.1204 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  15.8028    4.4730   11.4356 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  16.0291    5.0060   12.1887 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  14.4947    4.4583   10.9677 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  13.8365    4.9854   11.4047 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  14.1295    3.6811    9.8633 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  12.7296    3.6539    9.3576 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  12.4513    3.1981    8.0262 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  13.1752    2.9915    7.4479 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  11.1789    3.0548    7.5697 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  11.0329    2.7482    6.6827 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  10.0578    3.3577    8.4035 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  10.3151    3.8805    9.7177 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  11.6670    4.0157   10.1533 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  11.8381    4.3664   11.0195 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  8.7415    3.1643    7.9850 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  8.5780    2.8158    7.1163 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  2.8457   -0.7712   12.3980 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  3.0678   -1.3212   13.1399 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.5364   -0.7506   11.9312 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  0.8734   -1.2792   12.3596 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.1935    0.0368   10.8466 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  0.2965    0.0566   10.5345 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  2.1690    0.7970   10.2192 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.9428    1.3300    9.4661 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  3.4772    0.7823   10.6872 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  4.1353    1.3094   10.2501 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  3.8424    0.0051   11.7916 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  5.2422   -0.0221   12.2972 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  5.5206   -0.4779   13.6287 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  4.7967   -0.6845   14.2070 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  6.7930   -0.6212   14.0852 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  6.9389   -0.9278   14.9722 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  7.9141   -0.3183   13.2513 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  7.6567    0.2045   11.9372 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  6.3049    0.3397   11.5015 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  6.1338    0.6904   10.6354 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  9.2303   -0.5117   13.6699 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  9.3939   -0.8602   14.5386 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  2  1  1  0  0  0
  3  1  4  0  0  0
  4  3  1  0  0  0
  5  3  4  0  0  0
  6  5  1  0  0  0
  7  5  4  0  0  0
  8  7  1  0  0  0
  9  7  4  0  0  0
10  9  1  0  0  0
11  1  4  0  0  0
11  9  4  0  0  0
12 11  1  0  0  0
13 12  4  0  0  0
14 13  1  0  0  0
15 13  4  0  0  0
16 15  1  0  0  0
17 15  4  0  0  0
18 17  4  0  0  0
19 18  4  0  0  0
19 12  4  0  0  0
20 19  1  0  0  0
21 17  4  0  0  0
22 21  1  0  0  0
18 65  4  0  0  0
24 23  1  0  0  0
25 23  4  0  0  0
26 25  1  0  0  0
27 25  4  0  0  0
28 27  1  0  0  0
29 27  4  0  0  0
30 29  1  0  0  0
31 29  4  0  0  0
32 31  1  0  0  0
33 23  4  0  0  0
33 31  4  0  0  0
34 33  1  0  0  0
35 34  4  0  0  0
36 35  1  0  0  0
37 35  4  0  0  0
38 37  1  0  0  0
39 37  4  0  0  0
40 39  4  0  0  0
41 40  4  0  0  0
41 34  4  0  0  0
42 41  1  0  0  0
43 39  4  0  0  0
44 43  1  0  0  0
40 87  4  0  0  0
46 45  1  0  0  0
47 45  4  0  0  0
48 47  1  0  0  0
49 47  4  0  0  0
50 49  1  0  0  0
51 49  4  0  0  0
52 51  1  0  0  0
53 51  4  0  0  0
54 53  1  0  0  0
55 45  4  0  0  0
55 53  4  0  0  0
56 55  1  0  0  0
57 56  4  0  0  0
58 57  1  0  0  0
59 57  4  0  0  0
60 59  1  0  0  0
61 59  4  0  0  0
62 61  4  0  0  0
63 62  4  0  0  0
63 56  4  0  0  0
64 63  1  0  0  0
65 61  4  0  0  0
66 65  1  0  0  0
62 21  4  0  0  0
68 67  1  0  0  0
69 67  4  0  0  0
70 69  1  0  0  0
71 69  4  0  0  0
72 71  1  0  0  0
73 71  4  0  0  0
74 73  1  0  0  0
75 73  4  0  0  0
76 75  1  0  0  0
77 67  4  0  0  0
77 75  4  0  0  0
78 77  1  0  0  0
79 78  4  0  0  0
80 79  1  0  0  0
81 79  4  0  0  0
82 81  1  0  0  0
83 81  4  0  0  0
84 83  4  0  0  0
85 84  4  0  0  0
85 78  4  0  0  0
86 85  1  0  0  0
87 83  4  0  0  0
88 87  1  0  0  0
84 43  4  0  0  0
M  END

3万

帖子

99

威望

3万

eV
积分
72633

管理员

公社社长+计算化学玩家

发表于 2021-7-31 10:37:10 | 显示全部楼层
量化新生 发表于 2021-7-31 10:33
mol文件有一丢丢问题,串行了两个,重新附上
DPA-dimer
  MatStudio         3D                         ...

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班基础(中级)量子化学培训班分子动力学与GROMACS培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班。这些培训是计算化学快速入门以及全面系统性提升研究水平的最佳途径,培训各种相关信息见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息、避免错过网上最有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气最高、水准最高的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395(已满),2号:466017436(已满),3号:764390338(可加)。合计8000人,讨论范畴相同
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

3

帖子

0

威望

67

eV
积分
70

Level 2 能力者

 楼主| 发表于 2021-7-31 15:06:30 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2021-7-31 10:37
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员 ...

抱歉抱歉,我以为发完贴就编辑不了了。不好意思。主要还是望解答疑惑,萌新下次注意

3万

帖子

99

威望

3万

eV
积分
72633

管理员

公社社长+计算化学玩家

发表于 2021-8-1 10:34:37 | 显示全部楼层
分清楚3.8和3.8(dev),前者迄今没发布过


就是你说的含义。Multiwfn目前只能基于TrESP电荷近似计算,没法按照你截图里那个式子严格按照积分来计算。
怎么算在4.A.9第三部分已经明确描述了,先用Multiwfn算相应跃迁对应的TrESP电荷,再通过TrESP电荷让Multiwfn直接根据库仑公式计算


就是优化基态二聚体结构(如果你想计算其它有特殊意义的结构下的激子耦合也可以用其它结构)


明显不能直接用B3LYP优化,这是弱相互作用体系最基本的计算常识,仔细看
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html

你贴的文件我没法正常载入
mol不可能不能上传,例: a.mol (533 Bytes, 下载次数: 1)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班基础(中级)量子化学培训班分子动力学与GROMACS培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班。这些培训是计算化学快速入门以及全面系统性提升研究水平的最佳途径,培训各种相关信息见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息、避免错过网上最有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气最高、水准最高的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395(已满),2号:466017436(已满),3号:764390338(可加)。合计8000人,讨论范畴相同
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!
您需要登录后才可以回帖 登录 | 现在注册!

本版积分规则

手机版|小黑屋|北京科音自然科学研究中心|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )

GMT+8, 2021-9-20 03:19 , Processed in 0.229024 second(s), 27 queries .

快速回复 返回顶部 返回列表