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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn资源与经验] 使用Multiwfn通过ETS-NOCV方法深入分析片段间的轨道相互作用

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发表于 Post on 2022-10-10 20:37:17 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师你好,在教程中你提到14 Calculate composition of NOCV orbitals and pairs.但是我在菜单中并未发现选项14,其他选项也挨着试了并没有文中提到的结果。请问这是笔误吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-11 22:01:15 | 只看该作者 Only view this author
liangsirskku 发表于 2022-10-10 20:37
Sob老师你好,在教程中你提到14 Calculate composition of NOCV orbitals and pairs.但是我在菜单中并未发 ...

版本太老
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发表于 Post on 2022-10-13 11:28:28 | 只看该作者 Only view this author

谢谢sob老师指出!

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发表于 Post on 2022-10-22 10:36:36 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 护卫天使 于 2022-10-22 10:38 编辑

老师好,对于ETS-NOCV分析,片段自旋多重度比较麻烦。这是我计算的复合物和三个片段的设置,麻烦老师帮忙看一下这样设置是否可行。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-23 04:24:10 | 只看该作者 Only view this author
护卫天使 发表于 2022-10-22 10:36
老师好,对于ETS-NOCV分析,片段自旋多重度比较麻烦。这是我计算的复合物和三个片段的设置,麻烦老师帮忙看 ...

可以
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发表于 Post on 2022-10-23 09:33:29 | 只看该作者 Only view this author
老师,这种算法,如果使用激发态波函数的文件可以做相关的分析吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-24 05:03:50 | 只看该作者 Only view this author
shiqiyuan 发表于 2022-10-23 09:33
老师,这种算法,如果使用激发态波函数的文件可以做相关的分析吗

只支持单行列式波函数
如果你是指KS-DFT算的激发态波函数可以,TDDFT之类不行
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发表于 Post on 2022-11-5 15:11:01 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 护卫天使 于 2022-11-5 15:21 编辑

再次向老师请教一下,我用34L文件的计算结果作了CDA分析,结果bcck donation这一项都是负数,这该如何解释?是否CDA对该体系不适用?而且我在ETS-NOCV分析中明显看到了电子反馈的现象。

1667632303404.jpg (11.23 KB, 下载次数 Times of downloads: 126)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-6 09:52:38 | 只看该作者 Only view this author
护卫天使 发表于 2022-11-5 15:11
再次向老师请教一下,我用34L文件的计算结果作了CDA分析,结果bcck donation这一项都是负数,这该如何解 ...

可以用6-31G*试试
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发表于 Post on 2022-11-7 10:00:19 | 只看该作者 Only view this author

好的感谢老师。
1、这么多负值的原因是单纯由基组引起的吗?
2、我对复合物的IRI和AIM分析还有计算结合能,计算级别都是PBE0/def2-tzvp级别。不知道在CDA和ETS-NOCV分析,假如用了不同的基组,这样是否合适?希望得到老师的解答。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-7 10:19:50 | 只看该作者 Only view this author
护卫天使 发表于 2022-11-7 10:00
好的感谢老师。
1、这么多负值的原因是单纯由基组引起的吗?
2、我对复合物的IRI和AIM分析还有计算结合 ...

1 可能是也可能不是
2 没有问题
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发表于 Post on 2022-11-9 16:08:08 | 只看该作者 Only view this author
护卫天使 发表于 2022-10-22 10:36
老师好,对于ETS-NOCV分析,片段自旋多重度比较麻烦。这是我计算的复合物和三个片段的设置,麻烦老师帮忙看 ...

老师好,对于这个体系,想先做个能量分解,再分析ETS-NOCV。老师博文中说到GAMESS-US软件最推荐,但是没有相关教程,输入文件相较麻烦。请问老师的EDA-FF方法是否适用?Multiwfn结合高斯作简单能量分解,但不能单独输出静电作用。

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发表于 Post on 2023-11-28 22:45:18 | 只看该作者 Only view this author
老师好,想请教一个问题。
看了您在本文中“3.4 弱相互相互作用的例子:A-T碱基对”这个研究分子间弱相互作用的例子。
以及您在http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html中提到
“值得一提的是,sobEDA/sobEDAw给出的轨道相互作用能ΔE_orb还可以用Multiwfn进一步通过ETS-NOCV方法进行分解,
能得到不同类型轨道相互作用的能量贡献以及对应的电子密度变化,对于探究片段间轨道相互作用本质极其有用!”

我想请教一下,分子间的这种弱相互作用的轨道类型是  “范德华轨道相互作用和静电轨道相互作用”   吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-29 00:24:17 | 只看该作者 Only view this author
LZHX2210 发表于 2023-11-28 22:45
老师好,想请教一个问题。
看了您在本文中“3.4 弱相互相互作用的例子:A-T碱基对”这个研究分子间弱相互 ...

不存在“静电轨道相互作用”这种说法
静电作用和轨道相互作用完全是两种不同的本质

看下文了解弱相互作用本质方面的相关常识
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413http://bbs.keinsci.com/thread-9772-1-1.html
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发表于 Post on 2025-7-18 08:58:37 | 只看该作者 Only view this author
社长,使用ETS-NOCV研究多金属体系有意义吗?例如研究酶里面的4Fe4S簇与周围氨基酸残基的轨道相互作用。
现在有三个问题:
1. 含有多个过渡金属的体系,使用DFT能得到正确的电子结构嘛?
2. 如果得不到,那基于此电子结构做的轨道分析还有意义吗?
3. 当过渡金属多的时候,如何找到正确的轨道,看局域轨道,感觉很难将具体轨道放到对应的金属上,有没有什么好的方法划分轨道到具体原子上的贡献

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