计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn资源与经验] 使用Multiwfn通过ETS-NOCV方法深入分析片段间的轨道相互作用

[复制链接 Copy URL]

19

帖子

0

威望

145

eV
积分
164

Level 3 能力者

31#
发表于 Post on 2022-10-10 20:37:17 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师你好,在教程中你提到14 Calculate composition of NOCV orbitals and pairs.但是我在菜单中并未发现选项14,其他选项也挨着试了并没有文中提到的结果。请问这是笔误吗?

捕获1.PNG (91.81 KB, 下载次数 Times of downloads: 69)

捕获1.PNG

捕获2.PNG (23.75 KB, 下载次数 Times of downloads: 72)

捕获2.PNG

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

32#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-11 22:01:15 | 只看该作者 Only view this author
liangsirskku 发表于 2022-10-10 20:37
Sob老师你好,在教程中你提到14 Calculate composition of NOCV orbitals and pairs.但是我在菜单中并未发 ...

版本太老
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

19

帖子

0

威望

145

eV
积分
164

Level 3 能力者

33#
发表于 Post on 2022-10-13 11:28:28 | 只看该作者 Only view this author

谢谢sob老师指出!

178

帖子

0

威望

737

eV
积分
915

Level 4 (黑子)

34#
发表于 Post on 2022-10-22 10:36:36 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 护卫天使 于 2022-10-22 10:38 编辑

老师好,对于ETS-NOCV分析,片段自旋多重度比较麻烦。这是我计算的复合物和三个片段的设置,麻烦老师帮忙看一下这样设置是否可行。

3.gjf

214 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 6

2.gjf

1.01 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

1.gjf

1.66 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

complexe.gjf

2.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 8

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

35#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-23 04:24:10 | 只看该作者 Only view this author
护卫天使 发表于 2022-10-22 10:36
老师好,对于ETS-NOCV分析,片段自旋多重度比较麻烦。这是我计算的复合物和三个片段的设置,麻烦老师帮忙看 ...

可以
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

8

帖子

0

威望

626

eV
积分
634

Level 4 (黑子)

36#
发表于 Post on 2022-10-23 09:33:29 | 只看该作者 Only view this author
老师,这种算法,如果使用激发态波函数的文件可以做相关的分析吗

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

37#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-24 05:03:50 | 只看该作者 Only view this author
shiqiyuan 发表于 2022-10-23 09:33
老师,这种算法,如果使用激发态波函数的文件可以做相关的分析吗

只支持单行列式波函数
如果你是指KS-DFT算的激发态波函数可以,TDDFT之类不行
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

178

帖子

0

威望

737

eV
积分
915

Level 4 (黑子)

38#
发表于 Post on 2022-11-5 15:11:01 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 护卫天使 于 2022-11-5 15:21 编辑

再次向老师请教一下,我用34L文件的计算结果作了CDA分析,结果bcck donation这一项都是负数,这该如何解释?是否CDA对该体系不适用?而且我在ETS-NOCV分析中明显看到了电子反馈的现象。

1667632303404.jpg (11.23 KB, 下载次数 Times of downloads: 79)

1667632303404.jpg

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

39#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-6 09:52:38 | 只看该作者 Only view this author
护卫天使 发表于 2022-11-5 15:11
再次向老师请教一下,我用34L文件的计算结果作了CDA分析,结果bcck donation这一项都是负数,这该如何解 ...

可以用6-31G*试试
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

178

帖子

0

威望

737

eV
积分
915

Level 4 (黑子)

40#
发表于 Post on 2022-11-7 10:00:19 | 只看该作者 Only view this author

好的感谢老师。
1、这么多负值的原因是单纯由基组引起的吗?
2、我对复合物的IRI和AIM分析还有计算结合能,计算级别都是PBE0/def2-tzvp级别。不知道在CDA和ETS-NOCV分析,假如用了不同的基组,这样是否合适?希望得到老师的解答。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

41#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-7 10:19:50 | 只看该作者 Only view this author
护卫天使 发表于 2022-11-7 10:00
好的感谢老师。
1、这么多负值的原因是单纯由基组引起的吗?
2、我对复合物的IRI和AIM分析还有计算结合 ...

1 可能是也可能不是
2 没有问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

178

帖子

0

威望

737

eV
积分
915

Level 4 (黑子)

42#
发表于 Post on 2022-11-9 16:08:08 | 只看该作者 Only view this author
护卫天使 发表于 2022-10-22 10:36
老师好,对于ETS-NOCV分析,片段自旋多重度比较麻烦。这是我计算的复合物和三个片段的设置,麻烦老师帮忙看 ...

老师好,对于这个体系,想先做个能量分解,再分析ETS-NOCV。老师博文中说到GAMESS-US软件最推荐,但是没有相关教程,输入文件相较麻烦。请问老师的EDA-FF方法是否适用?Multiwfn结合高斯作简单能量分解,但不能单独输出静电作用。

1

帖子

0

威望

41

eV
积分
42

Level 2 能力者

43#
发表于 Post on 2023-11-28 22:45:18 | 只看该作者 Only view this author
老师好,想请教一个问题。
看了您在本文中“3.4 弱相互相互作用的例子:A-T碱基对”这个研究分子间弱相互作用的例子。
以及您在http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html中提到
“值得一提的是,sobEDA/sobEDAw给出的轨道相互作用能ΔE_orb还可以用Multiwfn进一步通过ETS-NOCV方法进行分解,
能得到不同类型轨道相互作用的能量贡献以及对应的电子密度变化,对于探究片段间轨道相互作用本质极其有用!”

我想请教一下,分子间的这种弱相互作用的轨道类型是  “范德华轨道相互作用和静电轨道相互作用”   吗?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

44#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-29 00:24:17 | 只看该作者 Only view this author
LZHX2210 发表于 2023-11-28 22:45
老师好,想请教一个问题。
看了您在本文中“3.4 弱相互相互作用的例子:A-T碱基对”这个研究分子间弱相互 ...

不存在“静电轨道相互作用”这种说法
静电作用和轨道相互作用完全是两种不同的本质

看下文了解弱相互作用本质方面的相关常识
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413http://bbs.keinsci.com/thread-9772-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 06:50 , Processed in 0.210966 second(s), 29 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list