两个溶剂模型的问题求助

guoxh · 发表于 Post on 2021-8-4 14:24:53

sob老师，您好，有两个问题想请教一下老师，首先我们在计算溶解自由能时，选择的是，SMD溶剂模型在水溶剂下，而我们通过浏览“谈谈分子模拟中的隐式溶剂模型与GB模型”http://sobereva.com/42帖子，发现只有在准确考虑非极性效应时，才能正确考虑溶剂熵效应。其中该帖子指明正确考虑非极性部分需要在文件末尾写明 Abraham氢键酸碱度，气液界面表面张力，芳香度等参数吗，还是在文件开头书写solvent=water表明已经有相关参数的设置了。其次，上次请教老师已经了解到，按照http://sobereva.com/327帖子计算溶解自由能已经考虑到溶解熵的作用，想请问老师有相关文献支持吗，老师能列明一下吗？麻烦老师在百忙之中能够解答一下疑问，谢谢老师！

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-8-4 15:31:34

SMD模型自带了非极性参数，除非定义一种程序不支持的新溶剂，否则不需要写非极性参数。
溶剂熵的文献在你贴的链接里已经引了，J. Phys. Chem. A, 122, 1392 (2018)，下次提问之前记得仔细反复看，确实没有再问

guoxh · 发表于 Post on 2021-8-4 15:37:11

wzkchem5 发表于 2021-8-4 15:31
SMD模型自带了非极性参数，除非定义一种程序不支持的新溶剂，否则不需要写非极性参数。
溶剂熵的文献在你 ...

好哒，谢谢

sobereva · 发表于 Post on 2021-8-5 23:01:34

发帖时候必须恰当命名标题，为什么要用和我的博文完全相同的标题“谈谈分子模拟中的隐式溶剂模型与GB模型”？难道不觉得这会令其他人造成严重混淆么？用这样的标题是什么目的？

我把你的标题改了，下次再这样严重违规直接删帖扣分

仔细把此贴看了，遵守论坛规矩
http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html

guoxh · 发表于 Post on 2021-8-6 08:23:28

好的，对不起，麻烦老师了

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