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楼主 Author: 风飞
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[Multiwfn使用咨询] CDA电荷分解的片段定义问题

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发表于 Post on 2016-1-16 22:44:44 | 只看该作者 Only view this author
风飞 发表于 2016-1-16 20:47
老师:您好!在做CDA分解的时候出现闪退,可以麻烦您帮忙看看吗?我检查了关键词和原子序号,没找到原因, ...

不会闪退啊,用3.3.9(dev)版没问题。如果你的版本老,换成新版本

PS:较大的文本文件的附件请压缩后再上传,以节省论坛空间。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-17 10:10:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-16 22:44
不会闪退啊,用3.3.9(dev)版没问题。如果你的版本老,换成新版本

PS:较大的文本文件的附件请压缩后再 ...

老师:我又试了试,并且把版本也重新装了,可是还是出现了闪退,我输入整体化合物的时候,定义片段为两个,但是当我输入第一个片段的时候,就闪退了

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发表于 Post on 2016-1-17 10:15:26 | 只看该作者 Only view this author
风飞 发表于 2016-1-17 10:10
老师:我又试了试,并且把版本也重新装了,可是还是出现了闪退,我输入整体化合物的时候,定义片段为两个 ...

你载入的顺序不对吧,先载入
SbAuSb-(-3).out
然后依次
SbAuSb-(-3)_-sb.out
SbAuSb-(-3)_-_sbAu.out
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-17 11:17:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-17 10:15
你载入的顺序不对吧,先载入
SbAuSb-(-3).out
然后依次

老师:您好!我载入的顺序是按照您说的来做的,所以````,

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发表于 Post on 2016-1-18 00:26:10 | 只看该作者 Only view this author
风飞 发表于 2016-1-17 11:17
老师:您好!我载入的顺序是按照您说的来做的,所以````,

能正常载入啊,载入过程的输出信息都在附件里,你仔细对照一下

a.txt

15.6 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-20 14:55:48 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 风飞 于 2016-1-20 15:00 编辑
sobereva 发表于 2016-1-18 00:26
能正常载入啊,载入过程的输出信息都在附件里,你仔细对照一下

老师:您好!不知道为什么,在我的电脑上定义第一个片段时就会出现闪退的情况,这个可能是什么原因呢?谢谢,我重新装了multiwfn,还是这样,但是我其他的有一个结构却能用CDA,迷惑

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发表于 Post on 2016-1-20 15:03:27 | 只看该作者 Only view this author
风飞 发表于 2016-1-20 14:55
老师:您好!不知道为什么,在我的电脑上定义第一个片段时就会出现闪退的情况,这个可能是什么原因呢?谢 ...

看看是不是路径太长了,或者路径有奇怪的字符
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-20 15:10:34 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 风飞 于 2016-1-20 15:32 编辑
sobereva 发表于 2016-1-20 15:03
看看是不是路径太长了,或者路径有奇怪的字符

老师:我把我传给您的文件下载下来放到了另外一台电脑的桌面上,运行了一遍,还是在定义第一个片段的时候出现了闪退,可是我传给您,您就可以用,我这边就不行呢?您说是不是路劲太长,我是否需要重新生成新的out文件然后设置保存路劲短一些,还是只是移下位置呢?老师我上传了载入的过程的图片,麻烦您看看,谢谢,,

QQ图片20150102153328.png (17.1 KB, 下载次数 Times of downloads: 72)

QQ图片20150102153328.png

QQ图片20150102153341.png (18.33 KB, 下载次数 Times of downloads: 74)

QQ图片20150102153341.png

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发表于 Post on 2016-1-20 20:10:46 | 只看该作者 Only view this author
风飞 发表于 2016-1-20 15:10
老师:我把我传给您的文件下载下来放到了另外一台电脑的桌面上,运行了一遍,还是在定义第一个片段的时候 ...

别带双引号
文件路径有空格的时候你若直接把文件拖进去就会自动加上双引号
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-20 21:07:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-20 20:10
别带双引号
文件路径有空格的时候你若直接把文件拖进去就会自动加上双引号

恩,老师,弄好了。我把文件名中的空格给删了,就好了,,谢谢老师!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-20 22:29:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-1 20:23

片段和复合物计算基组必须严格一致

老师:您好!对于CDA分析的结果,我有如下不明之处:
1)d:表示的是片段1向片段2提供电子,b:表示片段2向片段1提供电子,d-b表示:片段1向片段2转移的净电子数,在我的部分输出结果中(黄色方框中),发现b值为负值,而且还比较大,:这个是否说明:片段2向片段1转移了-0.19个电子,也就是说片段1向片段2转移了0.19个e,可是这个为什么不和前面的d值一样呢?就像图片中的轨道98和99,很明显,轨道98的d值远远大于轨道99的,但是由于b值得差异,导致净电子转移的值99号大于98号,请问这说明什么问题呢?
2)老师:您帖子中说r非常的负,说明该轨道的形成降低了电子之间的斥力,请问这个“非常负”是指的是相对于该CDA的输出结果的值,还是有一定的范围和标准呢?
3)是否负的r所对应的轨道都是成键轨道呢?
4)这里的轨道编号是否和分子轨道的编号是对应的?
5)在您帖子中分析了b最大,d最大,这些是否也是只是一个相对于该CDA的输出结果而言,没有一定的标准,
6)您分析了b,d最大,r非常的负,那请问b(d)最负是否表示:片段1(2)想片段2(1)转移的电子最多,例如:d最负:片段2向片段1转移的电子最多,r非常负,表示成键轨道,若r非常正,表示的是什么呢?
这些问题有些重复啰嗦,还请老师见谅,期待老师的答复,谢谢!

QQ图片20150102221336.png (61.66 KB, 下载次数 Times of downloads: 84)

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发表于 Post on 2016-1-21 05:35:50 | 只看该作者 Only view this author
风飞 发表于 2016-1-20 22:29
老师:您好!对于CDA分析的结果,我有如下不明之处:
1)d:表示的是片段1向片段2提供电子,b:表示片段2 ...


1 d、b是分别计算的,公式不一样,d是用片段1的占据轨道与片段2的空轨道计算的,b是片段2的占据轨道与片段1的空轨道计算的。CDA特别适用的情况d、b都为正值,像此例b很负,说明可能有显著的极化效应掺进去,此时不能靠-0.19这个值说明电子转移。

2 没有什么标准

3 基本都是

4 和复合物的分子轨道编号对应

5 对

6 d、b的负值没法用于讨论电子转移,是极化作用所致。正值时才能讨论电子转移(但极化效应还是会掺入其中影响其数值)。

CDA主要就是给你个用于讨论电子转移的定性数据,定量算准整体转移量的话得用可靠的原子电荷计算方法计算片段电荷来讨论。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-21 09:38:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-21 05:35
1 d、b是分别计算的,公式不一样,d是用片段1的占据轨道与片段2的空轨道计算的,b是片段2的占据轨道与 ...

谢谢老师您的解答,那请问,r(涉及到极化效应的电子)为负基本可以 表示成键,那么r为正是否可以表示为反键轨道呢?还是可以表示其他?在什么情况下,他可以表示反键轨道呢?,谢谢!

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发表于 Post on 2016-1-21 09:54:51 | 只看该作者 Only view this author
风飞 发表于 2016-1-21 09:38
谢谢老师您的解答,那请问,r(涉及到极化效应的电子)为负基本可以 表示成键,那么r为正是否可以表示为 ...

正的情况一般对应反键轨道,建议结合轨道图形再进一步确认
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-21 10:43:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-21 09:54
正的情况一般对应反键轨道,建议结合轨道图形再进一步确认

恩 ,好的 谢谢老师!同样是否是正值越大,表示反键越程度越高

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