CDA电荷分解的片段定义问题

sobereva · 发表于 Post on 2016-1-21 12:09:48

风飞发表于 2016-1-21 10:43
恩，好的谢谢老师！同样是否是正值越大，表示反键越程度越高

往往如此

风飞 · 发表于 Post on 2016-1-21 12:12:14

sobereva 发表于 2016-1-21 12:09
往往如此

谢谢老师！

风飞 · 发表于 Post on 2016-1-26 10:53:43

sobereva 发表于 2016-1-21 12:09
往往如此

老师：您好！您看对于对于这样一个层状化合物，想考察C6H6对Pd3的贡献，在做CDA分析的时候，您觉得有必要分解为三个片段吗？例如分为片段1：C6H6 片段2：(PdCO)3 片段3：C6H6。还是可以就直接分解为两个片段：片段1：C6H6，片段2：(PdCO)3C6H6,您怎样看？谢谢！

sobereva · 发表于 Post on 2016-1-26 16:53:14

风飞发表于 2016-1-26 10:53
老师：您好！您看对于对于这样一个层状化合物，想考察C6H6对Pd3的贡献，在做CDA分析的时候，您觉得有必要 ...

没法说对Pd3的贡献，只能说C6H6与Pd3的相互作用。
可以分解为三个片段

风飞 · 发表于 Post on 2016-1-26 19:39:31

本帖最后由风飞于 2016-1-26 19:47 编辑

sobereva 发表于 2016-1-26 16:53
没法说对Pd3的贡献，只能说C6H6与Pd3的相互作用。
可以分解为三个片段

老师：您好！您之前说在CDA分析的结果中b和d出现负值是极化作用造成的，所以我们一般不考虑负的d和b的值，那么请问有-b或者是-d存在的那一行的d-b和r是否也不考虑和分析，例如图片中的94号中b和d都是正值，因此可以考虑d-b和r的值，相反95-99中d和b都是其中有一个或者是有两个是负值，所以他们所对应d-b和r的可以不考虑。但是我们可以单独的考虑正值的d和b,是吗？

sobereva · 发表于 Post on 2016-1-27 10:03:07

风飞发表于 2016-1-26 19:39
老师：您好！您之前说在CDA分析的结果中b和d出现负值是极化作用造成的，所以我们一般不考虑负的d和b的值 ...

如果d、b之一或两个都是明显负值，就不要讨论d-b，此时也没什么意义，没法对应电荷转移
如果负值很小，d-b还是可以讨论的。

风飞 · 发表于 Post on 2016-1-27 10:13:55

sobereva 发表于 2016-1-27 10:03
如果d、b之一或两个都是明显负值，就不要讨论d-b，此时也没什么意义，没法对应电荷转移
如果负值很小 ...

恩，好的谢谢老师！

风飞 · 发表于 Post on 2016-3-13 09:38:42

本帖最后由风飞于 2016-3-13 10:09 编辑

sobereva 发表于 2016-1-26 16:53
没法说对Pd3的贡献，只能说C6H6与Pd3的相互作用。
可以分解为三个片段

老师：最近做一个CDA分析，又出现问题了，我的把金属片段和非金属片段分开了，各个输入文件，请您看看附件，我把我的化合物拆分成了5个片段，由于片段1至片段4都是输入文件都是一样的，所以就只给您看了一个，由于体系中存在金属Co,所以加了匽示基组，但是单独定义片段金属时，不管有没有加那个pseudo=read,都出现这种错误，请问是什么原因呢？谢谢！

sobereva · 发表于 Post on 2016-3-13 09:49:24

风飞发表于 2016-3-13 09:38
老师：最近做一个CDA分析，又出现问题了，我的把金属片段和非金属片段分开了，各个输入文件，请您看看附 ...

哪有附件？

风飞 · 发表于 Post on 2016-3-13 10:10:42

sobereva 发表于 2016-3-13 09:49
哪有附件？

抱歉，老师可能是网速不好，传的时候出问题了，已经传好了谢谢

sobereva · 发表于 Post on 2016-3-13 10:13:25

风飞发表于 2016-3-13 10:10
抱歉，老师可能是网速不好，传的时候出问题了，已经传好了谢谢

截图看不全，你直接把高斯输入输出文件打包发上来

风飞 · 发表于 Post on 2016-3-13 10:28:32

本帖最后由风飞于 2016-3-13 13:55 编辑

sobereva 发表于 2016-3-13 10:13
截图看不全，你直接把高斯输入输出文件打包发上来

老师：您好！输入文件和对应out文件已经上传

sobereva · 发表于 Post on 2016-3-13 10:34:36

风飞发表于 2016-3-13 10:28
老师：您好！输入文件和对应out文件已经上传

CDA分析一定不要用弥散函数，在此文里特别强调了：
http://www.hanspub.org/journal/P ... .aspx?paperID=16370

Co2片段计算时可看到提示
Standard basis: SDD (6D, 10F)
而其它片段和整体计算时都是现实(5D, 7F)，因此不对应。为解决此问题，计算Co2的时候加上5d 7f关键词。

风飞 · 发表于 Post on 2016-3-13 10:48:19

本帖最后由风飞于 2016-3-13 10:59 编辑

sobereva 发表于 2016-3-13 10:34
CDA分析一定不要用弥散函数，在此文里特别强调了：
http://www.hanspub.org/journal/PaperInformation.a ...

老师：好的，谢谢老师。由于之前优化加了弥散，那么我现在进行CDA计算，是重新优化呢？还是只需要在定义片段的时候去掉弥散即可呢？谢谢！CDA分析说，ECDA并不适合超过两个片段的分析，因此对多个片段的净电子转移的分析，我们可以直接看CDA的d-b的结果是吗？您博文中说这个并不是很可靠，请问老师。您怎样看呢？谢谢！

sobereva · 发表于 Post on 2016-3-13 12:58:33

风飞发表于 2016-3-13 10:48
老师：好的，谢谢老师。由于之前优化加了弥散，那么我现在进行CDA计算，是重新优化呢？还是只需要在定 ...

去掉弥散再算单点即可。
如果你要考察每两个片段之间的转移，只能靠d-b，虽然不总是很可靠。如果感兴趣的只是最终片段的电荷分布，还是用合适的方法计算原子电荷考察为宜。

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