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[Multiwfn使用咨询] AdNDP研究多中心键级问题

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老师:您好!在使用multiwfn中研究多中心键级过程中,在第一次进行单中心双电子的搜索过程中共产生了28条轨道,提示说:residual valence electrons of all atoms in the search list:86.0908.,随后选取"0“然后选”28“,提示说"residual valence electrons of all atoms in the search list:31.288309.接着搜索2中2电子:输入0,然后是2,提示说:residual valence electrons of all atoms in the search list:31.288309,接着又输入0,然后16,提示说:residual valence electrons of all atoms in the search list:1.648299,此时轨道的占据情况如附件,然后提取前6个轨道,于是输入6,结果提示出如下错误,”picked orbitals shouldn`t be larger than candidation orbitals!但是我的candidation 轨道一共有16个,请问老师,这是怎么回事呢?谢谢老师!
   老师:您好!您看搜索一次多中心键级,就进行一次“去掉这些AdNDP轨道对密度的贡献,使得剩余电子变少”这样对吗?因为发现,如果不去掉的话,会产生很多很多的轨道。例如:在第一段所描述的,第一次搜索单中心轨道,出现28个AdNDP轨道,此时剩余电子数为86.0909., 然后依次选0,选28,此时剩余电子变成了31.288309,接着搜索2中心轨道(选2),轨道数变成了16,且剩余电子依然是31.0288309,接着再次去掉16个AdNDP轨道对密度的贡献(选0,16)显示剩余电子变成了1.648299.,老师,请问这样做对么?
   老师:还有就是关于阈值的设定,在Multiwfn中默认的是1.7,请问这个设置会随体系变化吗?如果会,一般是更具什么条件和标准来设定的呢?谢谢!
   老师:在搜索的过程中,从搜索1C-2e开始(此时的没有去掉这些AdNDP轨道对密度的贡献,轨道数是28,剩余电子是86.0908),紧接着就选2(直接进行2C-2e搜索是),剩余电子数还是86.0908,轨道数变成了284,此时再进行"去掉这些AdNDP轨道对密度的贡献",剩余电子数变为负数,这种情况应该是我搜索的不正确,是吗?但是我仍然可以通过7选项查看其AdNDP轨道,,这是怎么回事呢?老师,我怎样看才能知道我的搜索正确的呢?您文章中说是看剩余电子,如果是这样,那么我之前的操作”搜索一次多中心键级,就进行一次去这些AdNDP轨道对密度的贡献“的操作是正确的,对吗?
  老师:这个帖子可能比较啰嗦,希望您不要介意,我这个是边操作,边就想到的问题,所以·····请多多包涵

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发表于 Post on 2016-1-3 10:56:27 | 只看该作者 Only view this author
你取AdNDP轨道的思路完全不对,应该参考此文的例子中取轨道时候的讨论:
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
http://sobereva.com/138
取的数目不能随便设定。应当优先考虑取占据数接近2.0的,而且应结合candidate轨道图形考察。比如你附图中的,1-8号可以取,占据数都很接近2.0,但是9-16号占据数就明显低于2.0了,如果这时候就把它们取出来,从密度矩阵中扣除掉,本该在更多中心轨道搜索时取出来的占据数接近2.0轨道就没了,结果就不合理了。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2018-8-29 12:07:00 | 只看该作者 Only view this author
老师,你好 我在用AdNDP的时候,给一个8原子的近直链的体系设定了3中心搜索,找到了一个共轭的π键,但是轨道组成分析中,只有两个原子对这个π键有贡献;然后,设定了4中心搜索,也找到了一个共轭的π键,但在组成分析中,只有3个原子对这个π键有贡献,请问造成这个的原因是什么?

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发表于 Post on 2018-8-29 22:03:26 | 只看该作者 Only view this author
DavieK 发表于 2018-8-29 12:07
老师,你好 我在用AdNDP的时候,给一个8原子的近直链的体系设定了3中心搜索,找到了一个共轭的π键,但是轨 ...

最好把找到的轨道的截图给出来,否则描述得太抽象

轨道等值面看到的轨道分布,应该和计算的轨道里的原子的成份定性一致(但如果用Mulliken/SCPA等不兼容弥散函数的方法又用了弥散函数则另当别论)
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发表于 Post on 2018-8-30 11:03:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-8-29 22:03
最好把找到的轨道的截图给出来,否则描述得太抽象

轨道等值面看到的轨道分布,应该和计算的轨道里的原 ...

D:\Program Files\Multiwfn_3.5(dev)_bin_Win64\disli_11.png

disli_11.png (159.76 KB, 下载次数 Times of downloads: 52)

这个是3中心的轨道等值面图,mulliken分析中,O5的成分几乎没有,主要分布在Cu和O7上

这个是3中心的轨道等值面图,mulliken分析中,O5的成分几乎没有,主要分布在Cu和O7上

disli_16.png (145.74 KB, 下载次数 Times of downloads: 39)

这个是4中心的轨道等值面图,mulliken分析中,C1的成分几乎没有,主要分布在O5,Cu和O7上

这个是4中心的轨道等值面图,mulliken分析中,C1的成分几乎没有,主要分布在O5,Cu和O7上

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发表于 Post on 2018-8-30 15:33:44 | 只看该作者 Only view this author

改用Becke或者Hirshfeld方法计算轨道成份
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sobereva 发表于 2018-8-30 15:33
改用Becke或者Hirshfeld方法计算轨道成份

老师,我用了Hirshfeld方法,本质上和mulliken方法计算出来的结果没有什么区别,3中心的时候 ,O5的贡献度还是很小,4中心的C的贡献度还是很小,都接近于0。

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发表于 Post on 2018-8-30 18:41:57 | 只看该作者 Only view this author
DavieK 发表于 2018-8-30 17:15
老师,我用了Hirshfeld方法,本质上和mulliken方法计算出来的结果没有什么区别,3中心的时候 ,O5的贡献 ...

那就是说明贡献很小。目前看起来似乎贡献不可忽略是因为看轨道等值面图时isovalue取得较小所致
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