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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 量子化学 (Quantum Chemistry) › 关于计算文献中kJ/mol与kcal/mol的选用
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[新手求助] 关于计算文献中kJ/mol与kcal/mol的选用

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WaterMirror

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发表于 Post on 2021-8-24 01:36:49 | 只看该作者 Only view this author 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
本帖最后由 WaterMirror 于 2021-8-24 08:57 编辑

各位老师好！我最近想投一个计算的论文（目标是RSC/Wiley的期刊），我全文选用的能量单位是kJ/mol，感觉kcal/mol的数值太小了，相对值（△△G）分不开。现在很担心审稿人让我全部换掉。因为数据非常多。请问各位老师这个能量单位审稿人会很较真吗？？？
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wzkchem5

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发表于 Post on 2021-8-24 04:38:52 | 只看该作者 Only view this author
我觉得这个概率是有的，但是不大。。。圈子里虽然kcal/mol是主流，但是kJ/mol也不是没有。
不过说实话没必要因为“数值太小了，分不开”来选单位，只有两个数的差别小于0.1kcal/mol的时候，kcal/mol才会导致分不开，而DFT的误差比这个大多了，所以分开了也没用，你不能指着一个势垒为10.1kcal/mol的反应说它比另一个势垒为10.0kcal/mol的反应难发生。即使是极其相似的反应，DFT真能算准到0.1kcal/mol，那还有DFT格点误差，格点误差是随机误差，不管多么相似的反应也无法完全误差抵消，而且一般最少也得0.1kcal/mol量级。

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Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF（https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html）、ORCA（https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php）开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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WaterMirror

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-24 09:19:03 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-8-24 04:38
我觉得这个概率是有的，但是不大。。。圈子里虽然kcal/mol是主流，但是kJ/mol也不是没有。
不过说实话没必 ...

好的，谢谢老师！感觉就看命了。。。也不知道遇到咋样的审稿人。。。
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sobereva

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发表于 Post on 2021-8-24 11:36:03 | 只看该作者 Only view this author
审稿人只会在你的计算级别的精度上comment，不可能因为用kcal/mol还是kJ/mol去吐槽
但记得投国内的期刊应当都用kJ/mol，因为很多编辑执着于SI单位
北京科音自然科学研究中心（http://www.keinsci.com）致力于计算化学的发展和传播，长期开办极高质量的各种计算化学类培训：初级量子化学培训班、中级量子化学培训班、高级量子化学培训班、量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班、分子动力学与GROMACS培训班、CP2K第一性原理计算培训班，内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路！培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》。
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息，并避免错过网上有价值的计算化学文章！
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群（群号见此链接），合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔，提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog：http://sobereva.com（发布大量原创计算化学相关博文）
Multiwfn主页：http://sobereva.com/multiwfn（十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序）
Google Scholar：https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate：https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
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WaterMirror

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-24 18:46:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-8-24 11:36
审稿人只会在你的计算级别的精度上comment，不可能因为用kcal/mol还是kJ/mol去吐槽
但记得投国内的期刊应 ...

哦哦 好的。谢谢卢老师！
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xxtnenu

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发表于 Post on 2025-4-8 23:23:10 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-8-24 04:38
我觉得这个概率是有的，但是不大。。。圈子里虽然kcal/mol是主流，但是kJ/mol也不是没有。
不过说实话没必 ...

请问老师，1 kcal/mol 这个误差范围算比较大嘛？
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wzkchem5

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发表于 Post on 2025-4-9 08:57:00 | 只看该作者 Only view this author
xxtnenu 发表于 2025-4-8 23:23
请问老师，1 kcal/mol 这个误差范围算比较大嘛？

不能脱离语境说大不大。
你要是比较一个30kcal/mol的反应和一个20kcal/mol的反应哪个快，那1kcal/mol很小；
你要是算一个手性催化反应，R型产物自由能垒20.0kcal/mol，S型产物自由能垒20.5kcal/mol，那1kcal/mol就很大了，错1kcal/mol连ee值的符号都反了。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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Uus/pMeC6H4-/キ

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傻傻的木瓜
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发表于 Post on 2025-4-9 10:03:54 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2025-5-11 23:20 编辑
wzkchem5 发表于 2025-4-9 08:57
不能脱离语境说大不大。
你要是比较一个30kcal/mol的反应和一个20kcal/mol的反应哪个快，那1kcal/mol很 ...

从另一个帖http://bbs.keinsci.com/thread-80-1-1.html的6楼来看，这语境说的是不同位点C-H键解离能。

不过我有点好奇，毕竟都说1 kcal/mol是chemical accuracy的高目标，要达到如此高精度应该得严格控制方法、基组、团簇构型/分子构象、溶剂模型等等所有计算环节的系统误差吧，只要有一个环节误差稍微大点就只能得到inconclusive的结论。一般来说现在有多少这个层次的计算级别可供选择呢？

编辑：这帖也有些讨论
√546=23.36664289109
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Daniel_Arndt

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发表于 Post on 2025-4-9 10:18:25 | 只看该作者 Only view this author
一般地，美国人喜欢用kcal/mol，欧洲人喜欢用kJ/mol。如果你投的是ACS下面的期刊，就直接用kcal/mol。如果你投的是European Journal of Organic Chemistry，就考虑用kJ/mol吧。
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wzkchem5

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发表于 Post on 2025-4-9 10:51:43 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-4-9 10:03
从另一个帖http://bbs.keinsci.com/thread-80-1-1.html的6楼来看，这语境说的是不同位点C-H键解离能。

...

也得看你是比较两个很相似的反应，还是不那么相似的反应。
如果是手性催化，比R型和S型产物的自由能垒，那么DFT往往就够1kcal/mol精度了。
如果是差别很大的两个反应，即使DLPNO-CCSD(T)也未必够

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Uus/pMeC6H4-/キ + 1 有道理

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Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF（https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html）、ORCA（https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php）开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页：http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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