求助：是否有类似OCR的分子结构式识别软件？

Villain_IP · 发表于 Post on 2021-8-24 20:20:38

最近需要整理课题组合成出来的有机分子，打算做成一个数据集，未来做一些AI预测相关工作。但是数量实在太多了，凭我一己之力不太好完成，想问问大家是不是有类似OCR文字识别的程序来截取文档中的有机分子结构式？求推荐哈！

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-8-24 20:57:26

如果有chemdraw源文件，从chemdraw转SMILES应该有现成工具，也比OCR可靠

Villain_IP · 发表于 Post on 2021-8-25 09:12:25

wzkchem5 发表于 2021-8-24 20:57
如果有chemdraw源文件，从chemdraw转SMILES应该有现成工具，也比OCR可靠

谢谢朋友的回答哈，确实可以处理一部分从Chemdraw出来的源文件，可能我的数据还是比较麻烦，因为还有一大部分师兄师姐们的分子是在pdf里面

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-8-25 15:41:47

Villain_IP 发表于 2021-8-25 02:12
谢谢朋友的回答哈，确实可以处理一部分从Chemdraw出来的源文件，可能我的数据还是比较麻烦，因为还有一大 ...

先找师兄师姐要一下chemdraw源文件吧，有源格式识别准确度肯定高一些

喵星大佬 · 发表于 Post on 2021-8-25 19:10:36

最便宜可靠的方法，雇一群学生给你分分钟搞定

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-8-25 21:43:39

喵星大佬发表于 2021-8-25 12:10
最便宜可靠的方法，雇一群学生给你分分钟搞定

有道理，楼主所在的学校如果有老师开化学信息学课的话，可以问那个老师能不能在讲SMILES的时候把这个留成作业，每个学生分几个分子，转SMILES。。。

喵星大佬 · 发表于 Post on 2021-8-25 21:44:20

wzkchem5 发表于 2021-8-25 21:43
有道理，楼主所在的学校如果有老师开化学信息学课的话，可以问那个老师能不能在讲SMILES的时候把这个留成 ...

emmm。。。一肚子坏水wzk

Villain_IP · 发表于 Post on 2021-8-26 09:08:43

喵星大佬发表于 2021-8-25 19:10
最便宜可靠的方法，雇一群学生给你分分钟搞定

好办法，LOL！

greatzdk · 发表于 Post on 2021-8-26 12:46:56

https://cactus.nci.nih.gov/cgi-bin/osra/index.cgi

Andie · 发表于 Post on 2021-8-27 11:25:31

本帖最后由 Andie 于 2021-8-27 11:30 编辑

确实有分子结构OCR识别软件，最近在逛某乎论坛搜到一个软件介绍，名字叫"Img2Chem"，应该满足你想要的识别分子结构式的功能。我稍微拿了几个大环药物分子测试了一下，识别准确率还OK。看看适不适合你的体系。附上某乎链接：https://zhuanlan.zhihu.com/p/402508373
还有下载链接：http://chem.fulmz.com/img2chem.html?channelNumber=CSHOW

Villain_IP · 发表于 Post on 2021-8-27 18:11:52

Andie 发表于 2021-8-27 11:25
确实有分子结构OCR识别软件，最近在逛某乎论坛搜到一个软件介绍，名字叫"Img2Chem"，应该满足你想要的识别 ...

恩人啊！~~~这款软件很好用，我的分子（多环结构）都能识别出来，基本不需要修改，牛啊！感恩！

Villain_IP · 发表于 Post on 2021-8-27 18:14:43

greatzdk 发表于 2021-8-26 12:46
https://cactus.nci.nih.gov/cgi-bin/osra/index.cgi

谢谢朋友的热心帮助，这个网址我试了一下，可能是我的网的问题，图片一直上传不成功

但没关系，在10#楼找到替代的程序了，感谢哈！

qq0057655320 · 发表于 Post on 2021-9-14 10:17:19

这个可能有吧。

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[科研杂谈] 求助：是否有类似OCR的分子结构式识别软件？