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[Molcas] github中OpenMolcas获取下载文件及安装问题

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本帖最后由 发光 于 2021-8-26 10:44 编辑

各位老师上午好
    (操作均在CentOS7l inux虚拟机中进行)  我在利用 git clone获取OpenMolcas资源时,一开始200多KB,后来下载速度只有几KB,且下载到10%就会失败。(网络用的wifi, 浏览器能正常上网)
    接着在github网站直接下载,发现下载的external文件中lapack等文件均为空文件夹(在cmake ../OpenMolcas,提示缺少lapack;git submodule update --init External/lapack 出现'External/lapack' did not match any file(s) known to git ; yum安装lapack指定到External/lapack,又提示已经安装lapack)。

想请教老师:上述安装问题的原因是什么呢?为什么lapack文件夹是空的?希望老师们解疑,非常感谢!

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发表于 Post on 2021-8-26 09:58:43 | 只看该作者 Only view this author
保证网络正常。
完毕。
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喵星人

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发表于 Post on 2021-8-26 10:11:51 | 只看该作者 Only view this author
可能要**上网?
这问题没见过

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发表于 Post on 2021-8-26 10:11:57 | 只看该作者 Only view this author
lapack用系统自带的或者MKL即可

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-26 10:26:53 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 发光 于 2021-8-26 10:33 编辑
abin 发表于 2021-8-26 09:58
保证网络正常。
完毕。

谢谢您的回复。linux虚拟机本身是能上网的,老师您看是不是由于其他问题?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-26 10:33:01 | 只看该作者 Only view this author
pwzhou 发表于 2021-8-26 10:11
lapack用系统自带的或者MKL即可

我查了一下,自己系统确实有lapack,但是按照github安装步骤(1)cd OpenMolcas ; (2) git submodule update --init External/lapack
执行(2)开始报错 ,执行了git init 命令后 再执行(2) 出现新报错---External/lapack' did not match any file(s) known to git
所以安装步骤的(2)步要不要执行,还是有替代做法?希望老师解疑

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发表于 Post on 2021-8-26 10:33:40 | 只看该作者 Only view this author
发光 发表于 2021-8-26 10:26
谢谢您的回复。linux虚拟机本身是能上网的

访问github只有几KB/s,还会超时。
你管这叫做网络正常?
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-26 10:35:01 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2021-8-26 10:11
可能要**上网?
这问题没见过

谢谢老师的回复,折腾好多天了
老师是按照github上的教程安装的OpenMlocas吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-26 10:37:36 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2021-8-26 10:33
访问github只有几KB/s,还会超时。
你管这叫做网络正常?

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2021-8-26 10:47:16 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lyj714 于 2021-8-26 10:51 编辑

git clone和你直接下载是有区别的,执行git的一系列操作需要git clone下载的包。如果有lapack,可以跳过git submodule这一步

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发表于 Post on 2021-8-26 10:47:34 | 只看该作者 Only view this author
发光 发表于 2021-8-26 10:35
谢谢老师的回复,折腾好多天了。
老师是按照github上的教程安装的OpenMlocas吗

有好多种安装方法,你可以再看看说明书里面的,用系统自带的lapack或者MKL即可

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发表于 Post on 2021-8-26 11:06:58 | 只看该作者 Only view this author
安装教程看《量子化学程序OpenMolcas的简易安装》,下载的话,普通用户最好下载Releases里面的最新版,而非master。

LAPACK库最好用MKL的(用它自带的效率会比较低),安装MKL看《Linux下安装Intel oneAPI》;如果不想装2021版,也可以装2019或2020版,可以在论坛上搜parallel studio,有一堆帖子。如果你是在集群上安装,管理员往往都装好了,你只需module load xxx加载相应的库名称即可。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-26 13:05:32 | 只看该作者 Only view this author
lyj714 发表于 2021-8-26 10:47
git clone和你直接下载是有区别的,执行git的一系列操作需要git clone下载的包。如果有lapack,可以跳过git ...

好的,感谢前辈的回复

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-26 13:05:57 | 只看该作者 Only view this author
pwzhou 发表于 2021-8-26 10:47
有好多种安装方法,你可以再看看说明书里面的,用系统自带的lapack或者MKL即可

好的,万分感谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-26 13:06:18 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-8-26 11:06
安装教程看《量子化学程序OpenMolcas的简易安装》,下载的话,普通用户最好下载Releases里面的最新版,而非 ...

感谢老师的回复

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