关于分子对接前的能量优化问题

叶zoom1 · 发表于 Post on 2021-8-27 23:24:31

在使用modeller建模后，按照官网溶菌酶教程进行能量优化，在进行完能量最小化后还需要进行nvt以及npt平衡吗，请老师指教。

rpestana94 · 发表于 Post on 2021-8-28 00:49:05

It will help, also a short dynamic can help you to get a better structure to begin with

sobereva · 发表于 Post on 2021-8-28 14:35:53

关键性信息“分子对接前”绝对不要只体现在帖子标题里
NVT完全多余、毫无意义
做一段时间NPT令结构弛豫一下有好处

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[GROMACS] 关于分子对接前的能量优化问题