B-factor着色color bar极大极小值求助

landian666 · 发表于 Post on 2021-9-3 19:13:47

我用gmx rmsf 计算轨迹的均方根波动并用-oq 输出pdb文件进行 B-factor的着色，请问color bar的最大值和最小值怎么确定？我看手册里有the RMSF values are converted to B-factor values这么一句，但是不知道具体转换后的极大极小值是什么

snljty · 发表于 Post on 2021-9-3 20:01:40

打开pdb看一眼不就好了。

rpestana94 · 发表于 Post on 2021-9-3 21:27:11

You can take the column and do normalization and you get all the values between 0 to 1 for example, in the case you want more control

sobereva · 发表于 Post on 2021-9-3 22:05:51

默认情况下着色的上限和下限和所有原子B因子最大值、最小值是一致的。有必要就改，没必要就用默认

landian666 · 发表于 Post on 2021-9-7 15:41:54

多谢各位，已解决~~

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[GROMACS] B-factor着色color bar极大极小值求助

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