为什么不同溶剂下优化的结构相同

化小白 · 发表于 Post on 2021-9-14 16:04:32

老师，您好，我想问一下，为什么在SMD溶剂模型中用MO6-2X/def2-SVP优化KOAc，当溶剂是水时和当溶剂是三氟乙醇时优化出来的结构一样，KOAC是强电解质，在水溶液中不是应该解离，K与OAc不是应该分开吗？这点不是很理解

snljty · 发表于 Post on 2021-9-14 16:34:16

这两个离子都要用显式溶剂模型，只用隐式模型肯定是不够的。以水为例，钾离子的第一配位层必须用水饱和，剩下的部分再考虑用隐式溶剂。阴离子也应该尽量加上和其直接成氢键的水做显式模型。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-9-14 19:35:33

水溶液里只是K+和OAc-解离的状态的Gibbs自由能比K+和OAc-不解离的状态的Gibbs自由能低，只要前者比后者低得足够多，就观测不到不解离的状态。而不代表不解离的状态根本不存在。换句话说，所谓的强电解质可能是99%电离、99.9%电离，但一般不是100%电离，你发现不电离的状态存在，只说明电离不是100%，不代表KOAc不是强电解质

化小白 · 发表于 Post on 2021-9-14 20:51:33

snljty 发表于 2021-9-14 16:34
这两个离子都要用显式溶剂模型，只用隐式模型肯定是不够的。以水为例，钾离子的第一配位层必须用水饱和，剩 ...

老师，那是不是说阴离子和阳离子不能单纯的只用隐式溶剂模型来计算？如果用杂化溶剂模型的话，Gaussian是不是无法完成？

化小白 · 发表于 Post on 2021-9-14 20:55:10

wzkchem5 发表于 2021-9-14 19:35
水溶液里只是K+和OAc-解离的状态的Gibbs自由能比K+和OAc-不解离的状态的Gibbs自由能低，只要前者比后者低得 ...

好的，谢谢老师，我明白了

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-9-14 21:40:15

化小白发表于 2021-9-14 13:51
老师，那是不是说阴离子和阳离子不能单纯的只用隐式溶剂模型来计算？如果用杂化溶剂模型的话，Gaussian是 ...

杂化溶剂模型指的是第一配位层用显式溶剂化，外面用隐式溶剂化。而所谓的显式溶剂化就是放几个溶剂分子在分子周围，做构型搜索找到最稳定的结构。所以但凡是支持隐式溶剂化的程序，必然支持杂化溶剂模型，因为杂化溶剂模型相比隐式溶剂模型多出来的部分完全在于人工

sobereva · 发表于 Post on 2021-9-15 01:52:32

是M06-2X不是MO6-2X

用隐式溶剂模型优化的时候，你看到的现象再正常不过，因为此时势能面在结合的状态尚有极小点。不过如果你去算一下结合能，你会发现考虑隐式溶剂模型时的结合强度远低于在真空下的，溶剂效应从这个层面已经体现了（当然，隐式溶剂模型对离子体系明显不及杂化溶剂模型好）。如果你去跑动力学，也理应发现在隐式溶剂模型下K和OAc更容易解离。

化小白 · 发表于 Post on 2021-9-15 14:57:11

sobereva 发表于 2021-9-15 01:52
是M06-2X不是MO6-2X

用隐式溶剂模型优化的时候，你看到的现象再正常不过，因为此时势能面在结合的状态尚 ...

好的，谢谢老师

化小白 · 发表于 Post on 2021-9-15 14:57:51

wzkchem5 发表于 2021-9-14 21:40
杂化溶剂模型指的是第一配位层用显式溶剂化，外面用隐式溶剂化。而所谓的显式溶剂化就是放几个溶剂分子在 ...

好的，谢谢老师，我再试试

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