碳酸根负离子优化出错

hxy1 · 发表于 Post on 2021-9-22 16:31:31

请教下各位老师：我在对碳酸根负离子进行优化时，出现了键的断裂，不明原因，输入文件是#p opt freq b3lyp/6-31G** scrf=(solvent=chlorobenzene,pcm)

zjxitcc · 发表于 Post on 2021-9-22 16:46:57

先不谈结果，先看方法和基组，你需阅读如下sob老师的博文：
《谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正？”》http://sobereva.com/413
《谈谈量子化学中基组的选择》http://sobereva.com/336

关于断键，看《谈谈原子间是否成键的判断问题》http://sobereva.com/414

北大-陶豫 · 发表于 Post on 2021-9-22 18:55:14

你输入文件里的结构呢？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-9-22 20:00:22

另外，氯苯这种低极性溶剂里面，碳酸根负离子根本就不可能游离存在，一定会带着配阳离子。比如你用Cs2CO3做反应，实际起反应的要么是2n个Cs+和n个碳酸根负离子形成的簇，要么就是直接在Cs2CO3表面上反应的。甚至在DMF这种极性的溶剂里，碳酸根都未必是游离的，只有到水里才可以比较确定是完全游离的。
有机化学教材以及有机化学的文献，为了方便起见，可能画机理的时候直接写碳酸根负离子，这不代表他们做了实验证明碳酸根负离子在他们的反应条件下确实是游离的，而是代表碳酸根负离子是否带着阳离子对这个机理而言不重要

hxy1 · 发表于 Post on 2021-9-23 08:27:47

zjxitcc 发表于 2021-9-22 16:46
先不谈结果，先看方法和基组，你需阅读如下sob老师的博文：
《谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正？” ...

我学习一下，感谢老师的回复

hxy1 · 发表于 Post on 2021-9-23 08:29:38

北大-陶豫发表于 2021-9-22 18:55
你输入文件里的结构呢？

当时图片无法上传

只有一个碳酸根离子

hxy1 · 发表于 Post on 2021-9-23 08:33:55

wzkchem5 发表于 2021-9-22 20:00
另外，氯苯这种低极性溶剂里面，碳酸根负离子根本就不可能游离存在，一定会带着配阳离子。比如你用Cs2CO3做 ...

针对我的体系，前面的步骤用的是氯苯溶剂，这一步反应就保持一致。碳酸跟不存在，那我重新考虑下该步骤的计算方式，感谢老师的回复。

fffff · 发表于 Post on 2021-9-23 16:11:44

zjxitcc 发表于 2021-9-22 16:46
先不谈结果，先看方法和基组，你需阅读如下sob老师的博文：
《谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正？” ...

邹神，请问一下这里有必要加色散矫正吗？我感觉似乎没有弱相互作用。还有基组方面的问题是算阴离子体系没加弥散函数嘛

冰释之川 · 发表于 Post on 2021-9-23 16:21:43

fffff 发表于 2021-9-23 16:11
邹神，请问一下这里有必要加色散矫正吗？我感觉似乎没有弱相互作用。还有基组方面的问题是算阴离子体系没 ...

加色散校正并没有坏处，而且不增加计算量；对于阴离子体系，基组中必须加弥散函数。

fffff · 发表于 Post on 2021-9-24 09:04:15

冰释之川发表于 2021-9-23 16:21
加色散校正并没有坏处，而且不增加计算量；对于阴离子体系，基组中必须加弥散函数。

好的，谢谢冰冰老师

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