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[Multiwfn使用咨询] 使用Multiwfn做基于分子力场的能量分解分析:AMBER力场和GAFF力场混用是否可以

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体系:石墨氮掺杂石墨烯(就是用一个N替换一个C)吸附过一硫酸盐(HSO5-),石墨烯边缘C原子用H饱和的
力场选择问题:石墨氮掺杂石墨烯直接用GaussView识别的AMBER力场原子类型,但GaussView中无法指认过一硫酸盐的AMBER力场原子类型,与过一硫酸盐结构相似的硫酸,用GaussView也无法指认AMBER力场原子类型。
请问:此时过一硫酸盐的力场用GAFF力场代替,即石墨烯部分用AMBER力场,而过一硫酸盐用GAFF力场,不知道是否可行。

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发表于 Post on 2021-9-25 17:36:08 | 只看该作者 Only view this author
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发表于 Post on 2021-9-25 20:12:59 | 只看该作者 Only view this author
本来就明确支持混用

这也是为什么这里合写在一起


用AMBER的原子类型就大写,用GAFF的就小写,可以同时出现在一个分子文件里

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-10-15 10:43:35 | 只看该作者 Only view this author
想请问各位老师,clayff力场和opls力场可以混用吗?我是想做有机污染物在石英表面吸附的动力学模拟,石英用clayff力场,有机污染物用opls力场,想请问各位老师,这样力场混用需要注意什么问题吗?

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发表于 Post on 2021-10-16 04:06:39 | 只看该作者 Only view this author
小潘潘 发表于 2021-10-15 10:43
想请问各位老师,clayff力场和opls力场可以混用吗?我是想做有机污染物在石英表面吸附的动力学模拟,石英用 ...

这个问题和本帖主题无关,不要借本帖问,否则会扰乱论坛讨论秩序
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