利用Gaussian自带的NBO3.1做含有NICS分析，最终得到的NLMO轨道异常

yaochuang · 发表于 Post on 2021-9-28 17:16:26

  各位老师，近期我在用Gaussian09 D.01做将NICS分解为NLMO轨道贡献时发现严重的问题，想请教各位老师如果使用NBO6的话能不能解决这样的问题呢？或者请帮我测试一下这个体系用NBO6分析会不会出问题，谢谢。

  主要问题：1. gaussian的log文件中显示1-18号NLMO轨道对NICS有贡献，但是绘图的时候发现1-8号轨道占据数为1,9-18占据数为0，然后108-110号NLMO轨道占据又变为1；
               2. 显示出的轨道也是非常诡异，和常规的对比非常奇怪，很难判断是sigma还是pi轨道。

所以我们怀疑是NBO3.1的问题，想请大家帮忙测试一下，NBO6是否依然有这样的问题。附件中包含相应的输入和输出，谢谢大家。

test.rar (1.47 MB, 下载次数 Times of downloads: 10)

snljty · 发表于 Post on 2021-9-28 17:56:46

也许可以参考卢老师博文《使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道》http://sobereva.com/134

对于Gaussian用户，可以在route section里写上pop=saveNBO或pop=saveNLMO，这样NBO轨道或NLMO就会分别代替分子轨道储存在chk文件里。然后用formchk程序将chk文件转化为fch文件，就可以读入Multiwfn来看NBO和NLMO了。注意fch文件中的轨道编号和Gaussian的NBO 3.1模块(L607)显示的轨道编号通常不一致，因为Gaussian在储存轨道前会对NBO或NLMO按照能量由低到高进行排序。比如在NBO输出信息最后显示
Reordering of NBOs for storage: 7 8 3 1 2 4 6 5 9 38 ...
那么就是说明chk/fch文件里的1号轨道对应于NBO7，2号轨道对应NBO8，3号轨道对应NBO3，4号轨道对应NBO1...无论你用gview看这个chk文件，还是用Multiwfn看相应的fch文件，当你选比如第2号轨道，显示的都是NBO8。

yaochuang · 发表于 Post on 2021-9-28 18:08:36

snljty 发表于 2021-9-28 17:56
也许可以参考卢老师博文《使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道》http://sobereva.com/134

嗯，是参考了这个博文的，是计算的结果感觉不合理。

sobereva · 发表于 Post on 2021-9-28 18:29:22

NBO 7就100刀，买了试试就算发现不是版本问题，倒也不亏

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