请问怎么使用GPU加速NAMD分子模拟呢

namd学者 · 发表于 Post on 2021-10-29 16:41:59

如题，想通过GPU加速计算NAMD分子模拟。1.直接下载NAMD 的CUDA版本就能实现GPU加速吗？还是说在运行的时候需要输入什么代码（指令）呢？

2.NAMD的GPU加速也可以平行多个程序吗？
谢谢各位。

darkseal · 发表于 Post on 2021-11-1 14:50:35

cuda 版不需要设置和参数。查看输出文件可以找到cuda是否在发挥作用。nvidia-smi命令也能看到namd是否在使用cuda.
当然可以parallel run

namd学者 · 发表于 Post on 2021-11-1 19:20:26

darkseal 发表于 2021-11-1 14:50
cuda 版不需要设置和参数。查看输出文件可以找到cuda是否在发挥作用。nvidia-smi命令也能看到namd是否在使 ...

好的，谢谢你的回答。

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