用DFTB+做单胞优化时出现error：processor grid too big是什么原...

snowislands

请问大家用DFTB+做单胞优化时出现Error：Processor grid (6 x 8) too big (> 5 x 5)是什么原因啊？
输入文件是这样的：
Geometry = GenFormat {
  96  F
  C    N    O    H
1        1        0.863200061         0.042700002         0.394200016
2        1        0.136800002         0.957300038         0.605800082
3        1        0.136799989         0.042700002         0.105800007
4        1        0.863200013         0.957300038         0.894199961
5        1        0.363199960         0.542700011         0.394200016
6        1        0.636800002         0.457299989         0.605800082
7        1        0.636800014         0.542700011         0.105800007
...
  0.0000000000         0.0000000000         0.0000000000
14.1990003586         0.0000000000         0.0000000000
  0.0000000000         4.8439998627         0.0000000000
-3.9252539048         0.0000000000        13.7070403969
}

Driver = ConjugateGradient {
  MovedAtoms = 1:-1
  MaxForceComponent = 1E-5
  MaxSteps = 5000
  AppendGeometries = Yes
  LatticeOpt = Yes
  OutputPrefix = "1a_JOWWIB_3ob31_opt.out"
}

Hamiltonian = DFTB {
  SCC = Yes
  SCCTolerance = 1.0E-08
  MaxSCCIterations = 1000
  SlaterKosterFiles = Type2FileNames {
     Prefix = "/DFTB+/scc/"
     Separator = "-"
     Suffix = ".spl"
  }
  MaxAngularMomentum = {
    N = "p"
    O = "p"
    C = "p"
    H = "s"
  }
   KPointsAndWeights = SupercellFolding {
             1 0 0
             0 1 0
             0 0 1
             0.0 0.0 0.0
    }
    Dispersion = LennardJones {
       Parameters = UFFParameters {}
    }
}

snowislands

请问有没有人会啊。。。

akakcolin

计算输入命令是啥，设置mpi了？

akakcolin

看不到你调用的哪个特征值求解器，你底层用scalapack啥的，比如求解器调用blacs的时候有个默认值的。这个从字面上猜测，最大的问题是 你结构太小了，计要调用更多的处理器触发错误。可能的解决方式：换个求解器，用单核跑

snowislands

akakcolin 发表于 2021-11-10 13:05
看不到你调用的哪个特征值求解器，你底层用scalapack啥的，比如求解器调用blacs的时候有个默认值的。这个从 ...

嗯，果然就是你说的结构太小了。。
输入信息全部贴出来了(除了坐标没显示完全)，其他的都是默认的设置。是小白一枚，还没仔细了解特征值求解器这些。。
提交到广州超算天河2号上算的，yhbatch  -N 2 -n 48。。。

snowislands

akakcolin 发表于 2021-11-10 13:05
看不到你调用的哪个特征值求解器，你底层用scalapack啥的，比如求解器调用blacs的时候有个默认值的。这个从 ...

谢谢谢谢啦~

akakcolin

snowislands 发表于 2021-11-11 19:45
嗯，果然就是你说的结构太小了。。
输入信息全部贴出来了(除了坐标没显示完全)，其他的都是默认的设置。 ...

你这也太浪费机器资源了，就您的问题，一个cpu跑就完事了，最多用4核，越多越浪费

snowislands

akakcolin 发表于 2021-11-12 11:45
你这也太浪费机器资源了，就您的问题，一个cpu跑就完事了，最多用4核，越多越浪费

噢噢。。后面扩胞跑动力学这样提交可行吧。。？扩胞后三四百原子

Aridea

akakcolin 发表于 2021-11-12 11:45
你这也太浪费机器资源了，就您的问题，一个cpu跑就完事了，最多用4核，越多越浪费

我记得社长还是哪位大佬帖子里说，dftb和xtb都是12核效率最高

snowislands

Aridea 发表于 2021-11-15 08:23
我记得社长还是哪位大佬帖子里说，dftb和xtb都是12核效率最高

噢噢，谢谢啦