CCSD(T)算不动较大体系有没有什么解决办法

sobereva · 发表于 Post on 2021-12-5 07:14:30

mfdsrax2 发表于 2021-12-4 23:13
还有一个问题，RIJK def2/JK和def2-TZVPP/C都是加速方法吗，如果不写是否可以提高精度？

里面有简要介绍
大体系弱相互作用计算的解决之道
http://sobereva.com/214
详谈Multiwfn产生ORCA量子化学程序的输入文件的功能
http://sobereva.com/490（http://bbs.keinsci.com/thread-13560-1-1.html）

sobereva · 发表于 Post on 2021-12-5 07:14:50

mfdsrax2 发表于 2021-12-4 23:11
好的可以了，程序运行时有两个警告，这个有影响吗？

============================================== ...

不用管

mfdsrax2 · 发表于 Post on 2021-12-5 22:17:03

每次算到DLPNO BASED TRIPLES CORRECTION这一步都会提示内存不足
[file orca_tools/qcmem.cpp, line 884, Process 24]: OUT OF MEMORY ERROR!
我用48核/2GB内存算16个原子的DLPNO-CCSD/def2-TZVPP，这个是内存给少了吗？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-12-5 22:36:18

mfdsrax2 发表于 2021-12-5 15:17
每次算到DLPNO BASED TRIPLES CORRECTION这一步都会提示内存不足
[file orca_tools/qcmem.cpp, line 884, ...

如果每个核都给2GB，应该是够的

mfdsrax2 · 发表于 Post on 2021-12-5 22:52:01

wzkchem5 发表于 2021-12-5 22:36
如果每个核都给2GB，应该是够的

我也觉得，关键词这么些应该是这个意思吧
|  1> ! DLPNO-CCSD(T1) RIJK TightPNO def2-TZVPP def2/JK def2-TZVPP/C tightSCF noautostart miniprint nopop
|  2> %maxcore  2000
|  3> %pal nprocs 48 end
|  4> * xyz 0 1

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-12-5 23:26:04

mfdsrax2 发表于 2021-12-5 15:52
我也觉得，关键词这么些应该是这个意思吧
| 1> ! DLPNO-CCSD(T1) RIJK TightPNO def2-TZVPP def2/JK de ...

应该没问题。另外你的机子有多大物理内存？maxcore足够不代表内存一定够，必须实际的物理内存也够才行

mfdsrax2 · 发表于 Post on 2021-12-5 23:27:58

wzkchem5 发表于 2021-12-5 23:26
应该没问题。另外你的机子有多大物理内存？maxcore足够不代表内存一定够，必须实际的物理内存也够才行

单节点48核64G内存

zjxitcc · 发表于 Post on 2021-12-6 00:21:20

mfdsrax2 发表于 2021-12-5 23:27
单节点48核64G内存

你机子才64G内存，你却在输入文件里指定2*48 = 96G内存？这不明摆着不够用么。。。

敢于指定2*48 = 96G内存的，机子上至少得有128G内存，你这个配置还离得很远。

mfdsrax2 · 发表于 Post on 2021-12-6 08:32:27

zjxitcc 发表于 2021-12-6 00:21
你机子才64G内存，你却在输入文件里指定2*48 = 96G内存？这不明摆着不够用么。。。

敢于指定2*48 = 96 ...

抱歉我写错了，单节点是24核64G内存，计算时用了2个节点

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-12-6 18:27:41

mfdsrax2 发表于 2021-12-6 01:32
抱歉我写错了，单节点是24核64G内存，计算时用了2个节点

会不会是提交脚本有什么问题，导致其实是在一个节点上跑的？
如果你只用一个节点跑，并且把maxcore相应地设小，看看会不会还出现这个问题？

mfdsrax2 · 发表于 Post on 2021-12-8 08:28:09

wzkchem5 发表于 2021-12-6 18:27
会不会是提交脚本有什么问题，导致其实是在一个节点上跑的？
如果你只用一个节点跑，并且把maxcore相应 ...

我试了一下，内存过大或者过小都会报OUT OF MEMORY ERROR!的错误
用单节点跑，24核/1GB，24核/2GB，12核/5GB，12核/2GB内存都会报内存不足，有的是在算三重激发态时出错，有的还没有算到CCSD就已经出错了，12核/4GB在结束的时候内存不足，但是程序也能正常结束，能够得到结果，只有12核/3GB能够正常算完，不太清楚ORCA的内存策略。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-12-8 16:42:37

mfdsrax2 发表于 2021-12-8 01:28
我试了一下，内存过大或者过小都会报OUT OF MEMORY ERROR!的错误
用单节点跑，24核/1GB，24核/2GB，12核 ...

这里有两种内存不足，一种是物理内存不足，一种是你设定的内存不足。
程序不知道这个机子有多少物理内存（原则上程序可以知道，但是考虑到当服务器有排队系统的时候，可能你只有权限用其中一部分物理内存，所以一般程序都要求你手动设定内存），它假设你输多少内存就是有多少内存可以用。那么有三种情况：
（1）你设的内存大于、等于、或者只略小于物理内存。此时程序以为你设多少就是有多少，因此用消耗内存比较大的算法，以求计算快，实际做计算才发现内存没那么多，于是不得不从头再来，换用消耗内存更小的算法，但是从写代码的角度，与其自动改用内存消耗较少的算法从头来过，更方便的做法是报错，让用户手动调小内存重跑。
（2）你设的内存明显小于物理内存，且大于那个内存消耗较少的算法消耗的内存。此时皆大欢喜，可以跑完。
（3）你设的内存小于那个内存消耗较少的算法需要的内存。此时没法做计算，程序报错。

mfdsrax2 · 发表于 Post on 2021-12-8 17:23:38

wzkchem5 发表于 2021-12-8 16:42
这里有两种内存不足，一种是物理内存不足，一种是你设定的内存不足。
程序不知道这个机子有多少物理内存 ...

是这样的

七尺贱 · 发表于 Post on 2024-1-20 20:27:30

wzkchem5 发表于 2021-12-8 16:42
这里有两种内存不足，一种是物理内存不足，一种是你设定的内存不足。
程序不知道这个机子有多少物理内存 ...

您好，我想问一下CCSD(T)-F12计算和DLPNO-CCSD(T)相比谁好点呢，我看着CCSD(T)-F12结合aug-cc-pVTZ就可以达到CCSD(T)/aug-cc-pV5Z精度。DLPNO-CCSD(T)/aug-cc-pVTZ算几十个原子体系还是很轻松的，CCSD(T)-F12/aug-cc-pVTZ可以算多大体系呢，服务器大概500G内存。我想算一个30原子的有机分子，不知道能不能算的动

zjxitcc · 发表于 Post on 2024-1-20 22:00:11

本帖最后由 zjxitcc 于 2024-1-20 22:02 编辑

七尺贱发表于 2024-1-20 20:27
您好，我想问一下CCSD(T)-F12计算和DLPNO-CCSD(T)相比谁好点呢，我看着CCSD(T)-F12结合aug-cc-pVTZ就可以 ...

你说的比法不成立。要这样比较：
CCSD(T)与CCSD(T)-F12比，差别在F12，同样基组下CCSD(T)-F12更准；
DLPNO-CCSD(T)与CCSD(T)比，前者是后者的近似，同样基组下CCSD(T)更准；
DLPNO-CCSD(T)-F12与CCSD(T)-F12比，前者是后者的近似，同样基组下后者更准。

另外，CCSD(T)-F12/aug-cc-pVTZ应该是算不动30个原子的体系的，DLPNO-CCSD(T)-F12肯定算得动。而且F12方法一般搭配适配基组，例如cc-pVTZ-F12。

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[新手求助] CCSD(T)算不动较大体系有没有什么解决办法

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